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建立自然保护区是保护生态环境、自然资源和生物多样性最重要和最有效的措施，同时也是维护生态安全，促进生态文明，实现社会经济可持续发展的重要保障。我国自1956年建立第一个自然保护区以来，已初步形成了类型比较齐全、布局比较合理、功能比较健全的自然保护区体系，使绝大多数珍稀、濒危野生动植物物种、重要的生态功能区域和其他有重要意义的自然保护对象，都得到了特殊的保护，保护区的保护、科研、宣传教育、环境资源可持续利用示范等各项功能也得到逐步发挥。
然而，经费不足多年来一直困扰我国自然保护区建设与管理。对于大多数自然保护区来说，国家和地方投资严重不足，无法满足保护区日常巡护、防火、宣传、办公、社区工作和科研等多项工作的需要，这实际上削弱了保护区多种功能的发挥。建立既符合自然保护区性质，又符合市场经济规律的自然保护区投资机制，以满足我国自然保护区建设和管理需要，促进保护区多种功能的发挥，已经成为我国自然保护区发展面临的主要课题之一。
本文首先运用公共经济学、环境经济学的理论和方法对自然保护区提供产品和服务的性质加以分析，评价了自然保护区的经济效益及受益者。然后根据我国自然保护区投资现状，总结了我国自然保护区的投资渠道和方式特征规律及影响因子，并对保护区的资金需求进行定性和定量分析。最后借鉴国际经验并结合我国自然保护区管理现状，建立了我国自然保护区投资机制的框架，并给出了完善保护区投资机制的政策建议。