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目的:
在中老年人群中进行吸烟对COMT rs4680多态性及甲基化影响的关联性研究,并探讨COMT基因甲基化与颈动脉硬化的关联。
方法:
选取2018年6月到2019年11月于我院保健科就诊的中老年男性130例,其中吸烟组64例,对照组66例。根据颈动脉超声结果将吸烟人群分为吸烟硬化组(38例),吸烟非硬化组(26例);将非吸烟人群分为非吸烟硬化组(30例),非吸烟非硬化组(36例)。收集所有受试人群的量表资料和5ml静脉血样。提取所有研究对象血样的基因组DNA,检测COMT rs4680的基因型。同时,使用Illumina公司Hiseq平台以2×150个基点双末端测序模式进行高通量测序,对所有研究对象的基因组甲基化水平进行检测。采用SPSS22.0进行统计学处理,应用Shapiro-Wilks进行正态性检验。对于正态分布资料,以均数±标准差(x-±s)表示,应用t检验进行分析;对于偏态分布资料,以中位数(四分位数间距)表示,应用Mann-Whitney秩和检验进行分析;定性资料以频数(频率)表示,定性资料及Hardy-Weinberg遗传平衡定律的吻合度检验应用卡方检验进行分析。P<0.05为差异有统计学意义。
结果:
1.吸烟组与对照组在年龄、文化程度上均无统计学差异(P>0.05)。
2.Hardy-Weinberg软件验证COMT基因型和等位基因频率分布符合HWE规律(P>0.05)。COMT基因型在130例受试者中的频率分布,GG型为55.4%,GA型为33.8%,AA型为10.8%;等位基因G为72.3%,A为26.7%;统计结果显示,吸烟组与对照组之间COMT rs4680基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义(P>0.05)。
3.吸烟组COMT基因32个CpG位点平均甲基化程度高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。分析吸烟组与对照组COMT基因32个CpG位点的甲基化状态。吸烟组CpG62和CpG81甲基化水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。进一步分析发现,吸烟组CpG32、CpG35、CpG37、CpG39、CpG51、CpG68、CpG70、CpG83、CpG89、CpG94、CpG114、CpG119、CpG121、CpG126、CpG138、CpG142、CpG147、CpG154、CpG158、CpG164、CpG170、CpG185、CpG190、CpG196、CpG205、CpG211、CpG214甲基化程度高于对照组;而吸烟组CpG66、CpG124、CpG131甲基化程度低于对照组,但差异无统计学意义(P>0.05)。
4.对COMT基因多态性位点与甲基化片段位点做线性回归分析可得,rs4680多态性与COMT甲基化无明显相关性(P>0.05)。
5.对非吸烟硬化组与非吸烟非硬化组COMT基因32个CpG位点甲基化程度分析可得,非吸烟硬化组的COMT基因CpG位点平均甲基化程度为(0.0092±0.0033)%,非吸烟非硬化组的COMT基因CpG位点平均甲基化程度为(0.0087±0.0027)%,两组COMT基因CpG位点平均甲基化程度差异无统计学意义(P>0.05)。对非吸烟硬化组与非吸烟非硬化组COMT基因CpG62、CpG81位点分析可得,非吸烟硬化组CpG62平均甲基化程度为(0.0068±0.0039)%,非吸烟非硬化组的CpG62平均甲基化程度为(0.0072±0.0030)%;非吸烟硬化组CpG81平均甲基化程度为(0.0102±0.0046)%,非吸烟非硬化组的CpG81平均甲基化程度为(0.0099±0.0041)%,两组CpG62、CpG81甲基化程度差异无统计学意义(P>0.05)。
结论:
1.本研究在中老年人群中检测了COMT基因及其32个甲基化位点,发现了COMT基因甲基化与吸烟相关,且吸烟者CpG62、CpG81位点的甲基化水平高于非吸烟者,这两个位点未在其他研究中报道过。
2.本研究未发现COMT rs4680多态性与吸烟的相关性,也未发现COMT rs4680甲基化与颈动脉硬化的相关性,之后可扩大样本量加以研究。
在中老年人群中进行吸烟对COMT rs4680多态性及甲基化影响的关联性研究,并探讨COMT基因甲基化与颈动脉硬化的关联。
方法:
选取2018年6月到2019年11月于我院保健科就诊的中老年男性130例,其中吸烟组64例,对照组66例。根据颈动脉超声结果将吸烟人群分为吸烟硬化组(38例),吸烟非硬化组(26例);将非吸烟人群分为非吸烟硬化组(30例),非吸烟非硬化组(36例)。收集所有受试人群的量表资料和5ml静脉血样。提取所有研究对象血样的基因组DNA,检测COMT rs4680的基因型。同时,使用Illumina公司Hiseq平台以2×150个基点双末端测序模式进行高通量测序,对所有研究对象的基因组甲基化水平进行检测。采用SPSS22.0进行统计学处理,应用Shapiro-Wilks进行正态性检验。对于正态分布资料,以均数±标准差(x-±s)表示,应用t检验进行分析;对于偏态分布资料,以中位数(四分位数间距)表示,应用Mann-Whitney秩和检验进行分析;定性资料以频数(频率)表示,定性资料及Hardy-Weinberg遗传平衡定律的吻合度检验应用卡方检验进行分析。P<0.05为差异有统计学意义。
结果:
1.吸烟组与对照组在年龄、文化程度上均无统计学差异(P>0.05)。
2.Hardy-Weinberg软件验证COMT基因型和等位基因频率分布符合HWE规律(P>0.05)。COMT基因型在130例受试者中的频率分布,GG型为55.4%,GA型为33.8%,AA型为10.8%;等位基因G为72.3%,A为26.7%;统计结果显示,吸烟组与对照组之间COMT rs4680基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义(P>0.05)。
3.吸烟组COMT基因32个CpG位点平均甲基化程度高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。分析吸烟组与对照组COMT基因32个CpG位点的甲基化状态。吸烟组CpG62和CpG81甲基化水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。进一步分析发现,吸烟组CpG32、CpG35、CpG37、CpG39、CpG51、CpG68、CpG70、CpG83、CpG89、CpG94、CpG114、CpG119、CpG121、CpG126、CpG138、CpG142、CpG147、CpG154、CpG158、CpG164、CpG170、CpG185、CpG190、CpG196、CpG205、CpG211、CpG214甲基化程度高于对照组;而吸烟组CpG66、CpG124、CpG131甲基化程度低于对照组,但差异无统计学意义(P>0.05)。
4.对COMT基因多态性位点与甲基化片段位点做线性回归分析可得,rs4680多态性与COMT甲基化无明显相关性(P>0.05)。
5.对非吸烟硬化组与非吸烟非硬化组COMT基因32个CpG位点甲基化程度分析可得,非吸烟硬化组的COMT基因CpG位点平均甲基化程度为(0.0092±0.0033)%,非吸烟非硬化组的COMT基因CpG位点平均甲基化程度为(0.0087±0.0027)%,两组COMT基因CpG位点平均甲基化程度差异无统计学意义(P>0.05)。对非吸烟硬化组与非吸烟非硬化组COMT基因CpG62、CpG81位点分析可得,非吸烟硬化组CpG62平均甲基化程度为(0.0068±0.0039)%,非吸烟非硬化组的CpG62平均甲基化程度为(0.0072±0.0030)%;非吸烟硬化组CpG81平均甲基化程度为(0.0102±0.0046)%,非吸烟非硬化组的CpG81平均甲基化程度为(0.0099±0.0041)%,两组CpG62、CpG81甲基化程度差异无统计学意义(P>0.05)。
结论:
1.本研究在中老年人群中检测了COMT基因及其32个甲基化位点,发现了COMT基因甲基化与吸烟相关,且吸烟者CpG62、CpG81位点的甲基化水平高于非吸烟者,这两个位点未在其他研究中报道过。
2.本研究未发现COMT rs4680多态性与吸烟的相关性,也未发现COMT rs4680甲基化与颈动脉硬化的相关性,之后可扩大样本量加以研究。