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本论文对广东省四个试验地点5年生的马尾松1个半同胞家系，包含8个全同胞家系的子代林进行调查，结合微卫星(SSR)标记和表达序列标签多态性(ESTP)的分子标记检测结果，分析了马尾松生长和产脂性状在家系间和家系内的变异，对杂交组合进行了评估，研究了马尾松半同胞、全同胞家系生长和产脂性状与分子标记的关联，为分子标记辅助选择提供依据。主要结果如下：
1、半同胞家系群体内各个家系的树高、胸径、产脂量三个性状的表现，家系12表现较好，推测母本脂24与父本材66的杂交组合较好。发现产脂量与树木的树高、胸径呈正相关关系。
2、筛选得到有多态性的SSR标记4个，ESTP标记15个，位点共31个，其中半同胞家系母本包含21个位点。
3、性状与分子标记关联的分析结果表明，半同胞群体三个性状在地点间和地点内区组间均存在极显著差异，全同胞家系间差异不显著。说明这三个性状受环境影响较大。根据生长和产脂量性状综合评价，家系7适应性较强，可在较广范围内推广，但要改善其管理条件，使产脂力有所增加，属于广谱型优良家系；其余7个家系应选择在适宜立地中种植，以充分发挥其效益，属于局地适应型优良家系。
4、对半同胞家系而言，标记PtIFG_9136不同基因型间树高生长存在显著差异、est8704不同基因型间产脂量有显著差异。对8个全同胞家系，也分别筛选到一些与树高、胸径或产脂量有显著关联的标记，可用于特定家系的分子标记辅助选择。
5、家系10和家系88亲本相同，制种年份不同，同一时间播种育苗，而分子标记与性状的关联关系在两个家系间差异较大，这为分子标记辅助选择带来一定的困难。