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改革开放以来，中国的加工贸易取得了长足的发展，我国加工贸易进出口总额1981年为25亿美元，2007年为9860亿美元，增长了394倍，对我国的经济发展起到了巨大的促进作用。但是，加工贸易在发展过程中也出现了一些不可忽视的问题，势必对我国未来的对外贸易和经济发展产生重要的影响。本文正是基于这样的现状，力求探索和解决我国加工贸易中的问题，从理论分析和实证检验的角度，讨论了我国加工贸易的发展问题。
首先，本文引入了加工贸易这一概念，结合各种定义以及中国的实际，准确界定了其内涵和外延进。其次，以国际分工理论为基础，搭建了加工贸易的理论平台，以要素禀赋理论作为本文解释加工贸易的基础，将动态比较优势和竞争优势进行有效的结合，形成我国加工贸易发展的理论指导，同时借助全球化理论来进一步解释加工贸易的动因，最后运用国际投资理论来分析加工贸易的影响。
在理论分析的基础上，文章梳理了我国加工贸易的发展现状，采用时间序列和逻辑序列并行的方法，先后论述了中国加工贸易发展的动因、发展历程、发展现状、发展特点，根据理论分析和实证检验，结合我国所面临的内外环境，合理预测了我国加工贸易的未来发展趋势。为了能够清晰透视加工贸易对我国经济的影响，文章采用计量经济学中的实证检验方法，首先从加工贸易对资源投入制造业、对区域经济（以广东省为例）的影响以及对整个国民经济的影响来检验和论证加工贸易对我国经济的积极影响，随后从宏观经济的各个方面，包括加工贸易带来的的技术进步、对产业结构升级的影响、劳动力就业效应等来进一步验证结论，从而坚定我们发展加工贸易的决心。然而，加工贸易的快速发展，也引起了诸多问题，像外贸依存度过高、产业带动能力有限、原材料过渡依赖进口以及走私、环境问题等，解决不好会影响我国加工贸易进一步的持续、健康发展，而且会对整个国民经济带来不利的影响。那么，如何解决发展过程中遇到的诸多问题？有没有好的发展模式？中国加工贸易的未来方向在那里？本文根据前面所进行的理论分析和实证分析，提出我国加工贸易要获得持续健康地的发展，必须走开放式的转型升级道路。
如何进行转型升级？文章首先从战略角度出发，创新地提出“创造动态比较优势，结合竞争优势”的发展战略及为实施此战略需要重点解决微观、中观、宏观三个层次的问题，以开放式转型为核心，促进我国加工贸易的外向循环和内向循环的有机联系。继而从政策的角度，分别将保税政策、产业政策、税收政策、区域政策、金融政策等纳入到转型升级的政策体系中来，用完善的政策体系来推动转型战略的顺利实施。同时，本文将“加工贸易新政”作为政策分析的纽带，深入剖析“新政”给中国加工贸易带来的影响。而针对内外新环境，加工贸易的主体——微观企业如何应对？文章从科学管理、提高创新能力、创立自有品牌的角度为加工贸易企业提供了应对措施。至此，我国加工贸易转型的战略选择、政策支持、企业应对，从宏观到微观，全面立体的展现了我国加工贸易转型升级的路径选择。
海关监管作为我国加工贸易监管的主要方面，对我国加工贸易的发展起到至关重要的作用，本文从监管理念、监管制度、监管方法三方面对我国海关监管的创新提出了建议，希望实现我国海关监管的变革，促进加工贸易的健康发展。