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研究背景
2020年全球癌症统计数据显示，在世界范围内，胃癌(gastric cancer)发病率位居恶性肿瘤的第五位，死亡率居第四位;在东亚人群中，胃癌发病率最高，占45.7％。早期胃癌患者的5年生存率可超过60％，但发生远处转移的晚期胃癌患者5年生存率仅约5％。胃癌早期症状隐匿，缺乏检测灵敏度高、特异性强的生物标志物，确诊时有超过60％的患者发生局部或远处转移。
lncRNA(long non-coding RNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA，占细胞所有非编码RNA含量的80％-90％,在表观遗传调控中发挥重要作用。研究表明，lncRNA可作为恶性肿瘤早期诊断、预后评估及药物治疗反应的潜在生物标记物。
lncRNAASH1L-AS1位于东亚人群胃癌易感染色质1q22区域，其在胃癌中的生物学功能及分子作用机制尚不清楚。
研究目的
揭示胃癌细胞中lncRNAASH1L-AS1的生物学功能及分子作用机制，为胃癌的早期诊断以及临床治疗提供新靶标和新思路。
研究方法
1.通过qRT-PCR检测lncRNAASH1L-AS1在胃癌患者肿瘤组织与配对的正常胃组织中表达水平。
2.构建慢病毒载体，获得稳定敲低或过表达lncRNAASH1L-AS1的胃癌细胞系，利用细胞增殖计数实验、平板克隆形成实验和裸鼠皮下成瘤实验确定lncRNAASH1L-AS1对胃癌细胞增殖能力的影响;利用划痕愈合实验和Transwell实验揭示lncRNAASH1L-AS1对胃癌细胞迁移和侵袭能力的影响。
3.通过qRT-PCR检测ASH1LmRNA在胃癌患者肿瘤组织与配对的正常胃组织中表达水平，并分析组织样本中ASH1LmRNA水平与lncRNAASH1L-AS1水平的相关性。
4.通过qRT-PCR检测胃癌细胞系中ASH1LmRNA水平是否受lncRNAASH1L-AS1水平影响。
5.通过平板克隆形成实验和Transwell实验探究ASH1L对胃癌细胞恶性表型的影响，在过表达lncRNAASH1L-AS1的基础上敲低ASH1L是否可以逆转胃癌细胞恶性表型。
6.通过RNA-pulldown实验联合蛋白质谱分析，鉴定胃癌细胞内与lncRNAASH1L-AS1物理结合的蛋白，并通过Westernblot实验及RIP实验进一步验证细胞中两者的相互作用。
7.利用Westernblot检测胃癌细胞中NMEl表达水平是否受lncRNAASH1L-AS1影响，利用Westernblot和细胞免疫荧光实验检测胃癌细胞中NMEl核质分布是否受lncRNAASH1L-AS1影响。
8.通过qRT-PCR检测NME1mRNA在胃癌患者肿瘤组织与配对的正常胃组织中表达水平，并分析组织样本中lncRNAASH1L-AS1和ASH1LmRNA水平与NME1mRNA水平相关性。
9.在胃癌细胞中，通过qRT-PCR检测ASH1L-AS1和ASH1L表达是否受NME1影响。
10.通过ChIP-seq和ChIP-qPCR实验探究ASH1L-AS1和ASH1L基因启动子区域NME1结合情况，并通过ChIP-seq实验确定ASH1L-AS1和ASH1L基因启动子区域H3K4me3修饰水平是否与NME1富集程度一致。
研究结果
1.lncRNAASH1L-AS1在胃癌组织中高表达。细胞表型实验结果显示，敲低lncRNAASH1L-AS1显著抑制胃癌细胞增殖和迁移，过表达lncRNAASH1L-AS1则显著增强胃癌细胞增殖和迁移。动物实验结果显示，过表达lncRNAASH1L-AS1显著促进胃癌细胞异种移植瘤的形成和恶性增殖。
2.lncRNAASH1L-AS1上调邻近编码基因ASH1L表达，在胃癌细胞中敲低ASHIL可显著抑制细胞恶性表型，在过表达lncRNAASH1L-AS1的基础上敲低ASH1L可逆转细胞恶性表型。
3.RNA-pulldown、蛋白质谱以及Westernblot实验，鉴定NMEl为lncRNAASHlL-ASl的结合蛋白。RIP实验显示NME1能显著富集细胞中lncRNAASH1L-AS1。在胃癌细胞中lncRNAASH1L-AS1结合并增加NME1蛋白在细胞核中的水平。与配对的正常胃组织相比，NME1在胃癌组织高表达，并且在组织样本中lncRNAASH1L-AS1和ASH1LmRNA水平均与NME1mRNA水平显著正相关。在胃癌细胞中敲低NME1，lncRNAASH1L-AS1和ASH1L下调;过表达NME1-NLS，lncRNAASH1L-AS1和ASH1L显著上调。ChIP实验表明NME1可结合在ASH1L-ASI和ASH1L基因启动子区域，并且过表达lncRNAASH1L-AS1组细胞与对照组细胞相比，ASH1L-AS1和ASH1L基因启动子区域NME1富集以及H3K4me3修饰程度明显更高。
结论
本研究发现在胃癌组织中lncRNAASH1L-AS1水平显著增高，lncRNAASH1L-AS1与NME1结合上调ASH1L-AS1及邻近编码基因ASH1L转录，促进胃癌恶性进展，靶向lncRNAASH1L-AS1有望成为胃癌临床治疗新策略。
2020年全球癌症统计数据显示，在世界范围内，胃癌(gastric cancer)发病率位居恶性肿瘤的第五位，死亡率居第四位;在东亚人群中，胃癌发病率最高，占45.7％。早期胃癌患者的5年生存率可超过60％，但发生远处转移的晚期胃癌患者5年生存率仅约5％。胃癌早期症状隐匿，缺乏检测灵敏度高、特异性强的生物标志物，确诊时有超过60％的患者发生局部或远处转移。
lncRNA(long non-coding RNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA，占细胞所有非编码RNA含量的80％-90％,在表观遗传调控中发挥重要作用。研究表明，lncRNA可作为恶性肿瘤早期诊断、预后评估及药物治疗反应的潜在生物标记物。
lncRNAASH1L-AS1位于东亚人群胃癌易感染色质1q22区域，其在胃癌中的生物学功能及分子作用机制尚不清楚。
研究目的
揭示胃癌细胞中lncRNAASH1L-AS1的生物学功能及分子作用机制，为胃癌的早期诊断以及临床治疗提供新靶标和新思路。
研究方法
1.通过qRT-PCR检测lncRNAASH1L-AS1在胃癌患者肿瘤组织与配对的正常胃组织中表达水平。
2.构建慢病毒载体，获得稳定敲低或过表达lncRNAASH1L-AS1的胃癌细胞系，利用细胞增殖计数实验、平板克隆形成实验和裸鼠皮下成瘤实验确定lncRNAASH1L-AS1对胃癌细胞增殖能力的影响;利用划痕愈合实验和Transwell实验揭示lncRNAASH1L-AS1对胃癌细胞迁移和侵袭能力的影响。
3.通过qRT-PCR检测ASH1LmRNA在胃癌患者肿瘤组织与配对的正常胃组织中表达水平，并分析组织样本中ASH1LmRNA水平与lncRNAASH1L-AS1水平的相关性。
4.通过qRT-PCR检测胃癌细胞系中ASH1LmRNA水平是否受lncRNAASH1L-AS1水平影响。
5.通过平板克隆形成实验和Transwell实验探究ASH1L对胃癌细胞恶性表型的影响，在过表达lncRNAASH1L-AS1的基础上敲低ASH1L是否可以逆转胃癌细胞恶性表型。
6.通过RNA-pulldown实验联合蛋白质谱分析，鉴定胃癌细胞内与lncRNAASH1L-AS1物理结合的蛋白，并通过Westernblot实验及RIP实验进一步验证细胞中两者的相互作用。
7.利用Westernblot检测胃癌细胞中NMEl表达水平是否受lncRNAASH1L-AS1影响，利用Westernblot和细胞免疫荧光实验检测胃癌细胞中NMEl核质分布是否受lncRNAASH1L-AS1影响。
8.通过qRT-PCR检测NME1mRNA在胃癌患者肿瘤组织与配对的正常胃组织中表达水平，并分析组织样本中lncRNAASH1L-AS1和ASH1LmRNA水平与NME1mRNA水平相关性。
9.在胃癌细胞中，通过qRT-PCR检测ASH1L-AS1和ASH1L表达是否受NME1影响。
10.通过ChIP-seq和ChIP-qPCR实验探究ASH1L-AS1和ASH1L基因启动子区域NME1结合情况，并通过ChIP-seq实验确定ASH1L-AS1和ASH1L基因启动子区域H3K4me3修饰水平是否与NME1富集程度一致。
研究结果
1.lncRNAASH1L-AS1在胃癌组织中高表达。细胞表型实验结果显示，敲低lncRNAASH1L-AS1显著抑制胃癌细胞增殖和迁移，过表达lncRNAASH1L-AS1则显著增强胃癌细胞增殖和迁移。动物实验结果显示，过表达lncRNAASH1L-AS1显著促进胃癌细胞异种移植瘤的形成和恶性增殖。
2.lncRNAASH1L-AS1上调邻近编码基因ASH1L表达，在胃癌细胞中敲低ASHIL可显著抑制细胞恶性表型，在过表达lncRNAASH1L-AS1的基础上敲低ASH1L可逆转细胞恶性表型。
3.RNA-pulldown、蛋白质谱以及Westernblot实验，鉴定NMEl为lncRNAASHlL-ASl的结合蛋白。RIP实验显示NME1能显著富集细胞中lncRNAASH1L-AS1。在胃癌细胞中lncRNAASH1L-AS1结合并增加NME1蛋白在细胞核中的水平。与配对的正常胃组织相比，NME1在胃癌组织高表达，并且在组织样本中lncRNAASH1L-AS1和ASH1LmRNA水平均与NME1mRNA水平显著正相关。在胃癌细胞中敲低NME1，lncRNAASH1L-AS1和ASH1L下调;过表达NME1-NLS，lncRNAASH1L-AS1和ASH1L显著上调。ChIP实验表明NME1可结合在ASH1L-ASI和ASH1L基因启动子区域，并且过表达lncRNAASH1L-AS1组细胞与对照组细胞相比，ASH1L-AS1和ASH1L基因启动子区域NME1富集以及H3K4me3修饰程度明显更高。
结论
本研究发现在胃癌组织中lncRNAASH1L-AS1水平显著增高，lncRNAASH1L-AS1与NME1结合上调ASH1L-AS1及邻近编码基因ASH1L转录，促进胃癌恶性进展，靶向lncRNAASH1L-AS1有望成为胃癌临床治疗新策略。