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果树病毒的扩散性很强，严重威胁着果树的生长发育。本实验通过对影响RT-PCR扩增因素进行研究，建立了苹果花叶病毒（ApMV）和李属矮缩病毒（PDV）的RT-PCR检测体系，并且对苹果花叶病毒（ApMV）的PCR体系进行优化设计。在回收纯化ApMV及PDV扩增的特异DNA片段的基础上，对其进行了克隆测序研究。主要结果如下：1）建立了ApMV和PDV的RT-PCR检测体系，进一步优化了ApMV RT-PCR检测体系，实现了高效低成本。结果表明，要获得良好的RT-PCR扩增，ApMV PCR体系中dNTPs 浓度要为100 μmol/L ，TaqE的用量为0.8 U，互补引物Pc浓度在0.18 μmol/L－1.8 μmol/L之间，同源引物Ph浓度为0.412 μmol/L－4.12 μmol/L，MgCL2的浓度为0.2 mmol/L。退火时间是60秒，退火温度在48℃-56℃之间；变性温度达到92℃，变性时间45秒，延伸时间60秒，循环40次。2）分别以ApMV 和PDV的病毒RNA为模板，通过RT-PCR技术获得了病毒特异扩增的部分CPgene cDNA片段，克隆到pUCmT载体上，构建了这两种病毒部分CPgene cDNA的重组质粒。序列分析表明，它们的核苷酸序列与国外已发表的序列的碱基数完全相同，进一步佐证了RT-PCR检测结果的可靠性。同源性也分别达到了92.17%、99%。