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观赏芍药是指芍药科(Paeoniaceae)芍药属(Paeonia L.)芍药组（Sect.Paeonia）具有观赏价值的多年生宿根花卉。它不仅是我国著名的传统花卉，在世界花卉市场中也占有重要的一席之地。芍药种质资源丰富，栽培历史悠久，遍布范围广泛，一般按照种源组成的不同可将其分为中国芍药品种群、欧洲芍药品种群和杂种芍药品种群三大类。尤其是杂种芍药品种群中的芍药具有花色明亮、花型独特、生长势旺、抗性强等显著的优良性状，正逐渐成为观赏芍药育种的新趋势。但国人对芍药的认识大多局限于中国芍药品种群，对欧洲芍药品种群、杂种芍药品种群中的西方栽培品种了解甚少，致使欧美地区培育的观赏特性优异的芍药品种在我国罕有应用，因而制约了我国芍药新品种培育的进程。本研究利用课题组多年从欧洲、美洲等地区引进、收集的观赏芍药新种质，从开发微卫星标记出发，探讨了89个欧美芍药新品种及部分重要亲本原种的遗传多样性，并构建了DNA指纹图谱。主要研究成果如下:
1.以二倍体品种‘Charlies White为材料，利用“磁珠富集法”构建了芍药的微卫星富集文库，从253个阳性克隆中挑选出193个进行测序，共得到82个微卫星位点，并设计引物50对。对这50对引物进行多态性筛选并对实验所需的PCR体系进行了优化，结果可得50对引物中共有15对具有多态性(30％)且15对引物均能扩增出清晰的条带。
2.利用开发出的15对芍药多态性引物对89份芍药属材料进行遗传多样性的研究。结果显示，89份材料均能被很好地扩增。15对引物共得到145个等位位点，其中多态性等位位点达140个(96.6％)，平均每对引物扩增出9.3个位点。有效等位位点从1.569到5.723变化，平均为3.795个。PIC含量的变化范围为0.362～0.825，平均0.678。遗传多样性指数最大为2.194，最小为1.082。89份材料的遗传相似系数变异范围为0.35～0.98，基于UPGMA法构建了89份材料的聚类图和主成分分析图。聚类图和主成分分析图基本能将芍药野生种与品种区分开，但在品种群分类上有所差异，聚类图较主成分分析更加能够体现材料间的遗传关系。综合以上数据可知，SSR标记所反映的多样性信息非常丰富。
3.根据15对引物的多态性信息含量和Shannon遗传多样性指数大小的大小筛选出10对特征引物进行61份欧美地区芍药品种指纹图谱的构建。结果可知，利用这些特征引物能够明显区分61份材料。从绘制的指纹图谱中可知，这些芍药新品种倍型丰富，有一条带、两条带，甚至出现了三条带、四条带，该指纹图谱为芍药新种质的鉴定和倍性确定奠定了理论基础。