LncRNA AFAP1-AS1在大肠癌中的表 达及临床意义

来源 :广州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhaohui1590
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:  大肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,随着生活条件的改善、生活方式及饮食习惯的改变,在我国大肠癌发病率逐渐增高。大肠癌的发生、发展是一个复杂的多因素、多步骤过程,与不良生活方式、环境因素、遗传易感因素及疾病史等密切相关。近年的研究表明,长片段非编码核糖核酸(lncRNA)在恶性肿瘤的发生、发展过程中具有重要的调控功能,其在大肠癌中起着类似癌基因或抑癌基因的作用。基因芯片技术能够筛选大肠癌组织中表达差异的lncRNA,为大肠癌的基础和临床研究带来新的手段。  目的:  1.通过基因芯片技术筛选大肠癌组织及癌旁正常组织中表达差异的lncRNA。  2.探讨lncRNA AFAP1-AS1在大肠癌组织和癌旁正常组织中的表达水平及其与大肠癌临床病理特征的关系。  3.分析AFAP1-AS1在大肠癌细胞株和大肠正常上皮细胞株中的表达状况。  4.探讨AFAP1-AS1的表达水平对大肠癌细胞增殖和凋亡的影响。  材料与方法  材料:  基因芯片筛选lncRNA的大肠癌标本(5例),AFAP1-AS1临床验证大肠癌标本(70例)均来源于2014年10月至2015年1月广州医科大学附属肿瘤医广州医科大学硕士学位论文  院胃肠外科标本库。大肠癌细胞株(HT26、HCT116、SW480、SW620)和大肠正常上皮细胞株(NCM460)获赠于广州医科大学化学致癌研究所。  方法:  1.采用基因芯片筛选并分析大肠癌组织与癌旁正常组织中差异表达的lncRNA。  2.运用定量逆转录-聚合酶链反应(qRT-PCR)方法,检测AFAP1-AS1在70例大肠癌组织和相应癌旁正常组织中的表达水平,并分析其表达水平与临床病理特征的关系。  3.运用qRT-PCR方法,分析AFAP1-AS1在大肠癌细胞株(HT26、HCT116、SW480、SW620)及大肠正常上皮细胞株(NCM460)中的表达水平。  4.采用siRNA转染AFAP1-AS1高表达的大肠癌细胞(HCT116、SW620),下调其AFAP1-AS1的表达水平;分别用细胞增殖实验和流式细胞术,检测AFAP1-AS1表达下调对大肠癌细胞体外增殖和凋亡的影响。  结果:  1.基因芯片检测结果,5例大肠癌组织中表达差异的lncRNA共5751个(P<0.05,大肠癌组织较癌旁正常组织表达量2倍或2倍以上),其中表达上调的lncRNA2310个,表达下调的lncRNA3441个。大肠癌组织中AFAP1-AS1的表达水平高于癌旁正常组织10.36倍(P<0.05)。  2.70例大肠癌患者癌组织中AFAP1-AS1的相对表达量(2-ΔCt)为0.166±0.092,癌旁正常组织的相对表达量(2-ΔCt)为0.037±0.005,大肠癌组织中AFAP1-AS1的相对表达量高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.01)。  3. AFAP1-AS1的表达水平与大肠癌患者的肿瘤大小、T分期、淋巴结转移、pTNM分期(Ⅰ/Ⅱ、Ⅲ/Ⅳ)、CEA水平显著相关(P<0.05),而与年龄、性别及远处转移无显著相关(P>0.05)。  4.与大肠正常上皮细胞NCM460相比,AFAP1-AS1的表达水平在大肠癌细胞株HCT116、SW620、HT29和SW480中高表达,相对表达倍数(2-ΔΔCt)分别是7.263±0.965(P<0.01)、6.258±2.092(P<0.01)、5.088±1.487(P<0.01)和3.851±1.451(P<0.05),差异均有统计学意义。  5.用siRNA-1和siRNA-2片段分别下调大肠癌细胞 HCT116和SW620中AFAP1-AS1的表达水平。在HCT116细胞中,与mock组(未转染组)相比,siRNA-1转染组、siRNA-2转染组和siRNA-NC组(阴性对照组)中细胞的增殖率为40.238±6.131%、46.199±9.897%和99.258±2.267%。siRNA-1转染组和siRNA-2转染组细胞增殖率比mock组下调60%(P<0.01)和54%(P<0.05),差异均有统计学意义。mock组和siRNA-NC组细胞增殖率无统计学差异(P>0.05)。在SW620细胞中,与mock组(未转染组)相比,siRNA-1转染组、siRNA-2转染组和siRNA-NC组(阴性对照组)中细胞的增殖率为33.718±2.524%、35.688±3.990%和97.501±4.656%。siRNA-1转染组和siRNA-2转染组细胞增殖率比mock组下调66%(P<0.01)和64%(P<0.01),差异均有统计学意义。mock组和siRNA-NC组细胞增殖率无统计学差异(P>0.05)。6.在HCT116细胞中,siRNA-1转染组和siRNA-2转染组细胞的平均凋亡率为13.883±1.410%和11.487±1.036%,mock组和siRNA-NC组细胞的平均凋亡率为6.757±1.325%和5.867±0.931%。siRNA-1转染组和siRNA-2转染组细胞的凋亡率比mock组上调7.126%(P<0.05)和4.730%(P<0.05),差异均有统计学意义。mock组和siRNA-NC组细胞凋亡率无统计学差异(P>0.05)。  结论:  1.大肠癌组织中AFAP1-AS1表达水平高于癌旁正常组织。  2.AFAP1-AS1的表达水平与大肠癌的肿瘤大小、T分期、淋巴结转移、pTNM分期(Ⅰ/Ⅱ、Ⅲ/Ⅳ)、CEA水平显著相关,而与年龄、性别及远处转移无显著相关。  3.大肠癌细胞中AFAP1-AS1的表达水平高于大肠正常上皮细胞;下调AFAP1-AS1的表达水平,抑制大肠癌细胞的体外增殖及促进大肠癌细胞的凋亡。AFAP1-AS1在大肠癌的发生和发展中可能起着类似癌基因的作用。
其他文献
目的:探讨贯叶连翘提取物(HP)对百草枯(PQ)诱导的急性大鼠肺微血管内皮细胞(rPMVEC)损伤的保护作用和可能机制。 方法:采用组织块法,在体外条件下培养大鼠肺微血管内皮细胞。将培养的大鼠肺微血管内皮细胞分为百草枯组、贯叶连翘提取物干预组、贯叶连翘提取物对照组以及空白对照组。同时向百草枯组和贯叶连翘提取物干预组加入百草枯溶液(0.1mmol/l)0.5小时后开始计时,再向上述两组分别添加
提出键参数f_i,在此基础上定义分子键连接性指数F=sum from i=1 to m(f_i)~(1/2)。考虑到氯原子的个数和位置的影响,引入距离指数L将F修正,得到修正的连接性指数F_X=F+L~(-.5
目的:研究细胞周期蛋白D1(cyclin D1)siRNA对口腔鳞癌细胞Tca8113凋亡的作用。方法:采用cyclin D1-siRNA慢病毒感染Tca8113,qPCR检测cyclin D1表达,MTT检测细胞活性,Annexin-
鸡西矿业集团公司张辰煤矿西三采区3
期刊
目的:胰岛素抵抗和胰岛B细胞分泌功能受损是影响糖尿病发生发展的两个重要因素。目前临床上比较常用空腹胰岛素值或联合空腹血糖值来评价胰岛素抵抗,以及用口服葡萄糖刺激胰岛
目的:检测扁平苔藓(Lichen Planus,LP)皮损中肥大细胞数和神经肽—P物质的表达,探讨肥大细胞和P物质在LP发病机制中的可能作用,为其神经免疫学研究提供依据。 方法:以28例LP患
藏红花苷是传统藏药藏红花含有的一种有极高药用价值的水溶性化合物.现代医学发现藏红花素的多种药理作用而受到越来越多的重视,包括抗氧化应激,抗炎症,改善焦虑、抑郁,改善
研究背景及目的:  新生儿窒息(Neonatal asphyxia)是新生儿期最常见的疾病之一。发生窒息后,如果短时间内没有恢复供氧,会导致新生儿死亡。恢复供氧后也可能导致二次损伤,出现一
目的:探讨r-AFS分期与EFI评分对EMs相关不孕患者腹腔镜术后行夫精宫腔内人工授精(AIH)的累积妊娠结局的预测价值。  方法:回顾性分析219名EMs不孕患者行452个AIH周期的病史资料
近年来结直肠癌的发病率呈逐渐上升趋势,而大部分结直肠癌是有结直肠腺瘤发展而来的.结肠镜检查时发现结直肠腺瘤的重要方法 ,但存在一定的漏诊率.结肠镜漏诊结直肠腺瘤的影