部分家兔品种微卫星DNA遗传多样性研究

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangkaixin
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本试验利用微卫星标记技术,分析了美系獭兔、德系獭兔、四平獭兔、法系獭兔、长毛兔和比利时兔6个家兔品种分子水平上的遗传多样性,分析了各品种间的遗传关系,为家兔遗传资源的合理利用及保护提供科学依据,研究结果如下: 1.10个微卫星位点在测定的6个品种中均表现出多态性,总共检测到41个等位基因,其中检测到的等位基因数最多为5个,最少的位点检测到3个;各群体在10个位点的有效等位基因数目从2.6620~4.7130不等,其中5、8、17三个位点检测到有效等位基因数较高,分别为4.7130、4.2909、4.2715。 2.计算出10个微卫星位点等位基因频率、有效等位基因数目和杂合度。10个微卫星位点的平均杂合度为0.4121~1.0000,除10号微卫星位点杂合度较低(0.4121)以外,其它位点的杂合度均较高;6个群体平均杂合度为0.8332~0.86875,属于高度杂合群体;10个微卫星位点的PIC值为0.55094~0.75355,均高于0.5,说明所选取的位点大多为高多态位点;6个群体的多态信息含量平均在0.624633~0.64624之间,结果表明所选出的10个微卫星位点在6个群体中多态性丰富。 3.通过群体间Nei氏标准遗传距离(Ds)和群体间Nei氏遗传距离(Da),得出总群体间的遗传分化系数为0.062171,总群体杂合度为0.734588,亚群体内杂合度为0.688917。这说明遗传变异主要存在于各个品种内,品种间遗传变异不大,6个群体间的遗传距离变异较小。 4.根据Ds和Da遗传距离进行UPGMA和NJ两种方法聚类,综合分析认为运用Ds距离所得的2个聚类图更能够比较正确地反映4个獭兔品种之间的聚类关系;而长毛兔和比利时兔群体聚类情况比较复杂,其中原因还有待于进一步研究论证。
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