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理论和实践表明，科学技术是推动一国经济发展和社会进步的重要因素。科技自主创新是连接科学技术和经济的纽带，其对一国经济和社会发展的重要作用已经被很多国家所认可，因此，是政府政策的重要作用对象。我国《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》指出要把提高自主创新能力摆在全部科技工作的突出位置。由于科技自主创新具有公共产品性、外部性、风险性和信息不确定性等特点，私人创新的边际收益小于社会创新的边际收益，致使私人部门创新意愿的降低，造成社会创新资源的投入不足。正是由于市场机制在科技自主创新的某些方面表现出失灵，才有了政府在这一领域进行干预活动的理论依据。在政府促进科技自主创新的诸多政策中，财税政策是最有效的政策工具之一。近年来，我国政府也采取了许多政策措施促进科技自主创新，但是与构建创新型国家的要求相比，与发达国家相比，我国目前的财税政策力度还远远不够，财税政策对科技自主创新的促进作用还没有充分发挥出来。因此，研究促进科技自主创新的财税政策，是一个既有理论意义、又有实践意义的课题。
本文采用规范分析和实证分析等方法对促进科技自主创新的财税政策进行研究。在研究过程中，首先从理论分析入手，提出财税政策介入的理论依据和作用机理；然后从财政科技投入政策、税收优惠政策和政府采购政策三方面详细归纳总结了我国促进科技自主创新的财税政策，并在此基础上分析了我国促进科技自主创新财税政策的不足之处；之后介绍了国外在财税政策方面促进科技自主创新的做法，为我国提供了经验借鉴；最后针对我国促进科技自主创新财税政策存在的问题，提出改革和完善的具体建议。
通过对财税政策促进科技自主创新的规范分析，以及财政科技投入、税收优惠、政府采购政策与科技自主创新关系的实证分析，本文得到以下结论：应该利用财税政策促进科技自主创新。同时，应结合科技自主创新链条中不同阶段的特点，完善促进科技自主创新的财税政策，发挥财税政策的推动作用，提高我国科技自主创新能力。