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随着经济和社会发展，高等教育和地方经济及社会发展更加紧密，高等教育的社会服务职能得到了更加充分的体现。高等教育能为社会提供各类人才、科技成果；地方政府的各项事业发展迫切需要具有一定科技知识、技能的人才和劳动者，尤其是发展地方高等教育以储备人才和加快科技开发，更加快速、稳定、有效地促进经济、文化、社会的进步与发展。因此，地方政府与高校合作，能够互惠互利，共同发展。在这种形式下高校与地方政府合作办学顺势而生。
本文分析了合作办学的基本理论问题以及高校与地方政府合作办学的相关问题。在分析高校与地方政府合作办学一般理论的基础上，具体以浙江海洋学院组建普陀科学技术学院为例，阐述了组建的过程，探讨合作办学形式下普陀科学技术学院的运行机制，并根据浙江海洋学院普陀科学技术学院在师资管理、教学管理、学生管理、后勤管理和考核评价体系上的经验，分析高校与地方政府合作办学的建设问题，同时对高校与地方政府合作办学进行理性思考，总结得出：科学的办学定位是前提，找准合作办学的结合点是基础，地方政府支持是保证，保证教育质量是关键。最后就高校与地方政府合作办学面临的问题进行罗列并提出解决的思路。