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广州管圆线虫(Angiostrongylus cantonensis)幼虫可入侵人体并停留在中枢神经系统，引起嗜酸粒细胞增多性脑膜脑炎。广州管圆线虫病作为一种新发的传染病正受到越来越多的重视，其许多生物学特性尤其是分子生物学方面的特性还未被认知。因此，寻找广州管圆线虫与宿主相互作用的抗原或过敏原及其功能蛋白，对广州管圆线虫病的预防和治疗有重要意义。
本研究从GenBank下载1277条广州管圆线虫的表达序列标签(EST)，用BlastX比对分析，并用SignalP V3.0预测潜在的抗原或过敏原相关蛋白N端是否具有分泌信号肽或信号锚定肽。结果显示，得分值大于80有695条，其中14条与广州管圆线虫一致，540条与其他物种的相关蛋白相匹配，60条与数据库中序列无同源性。614条序列可分为10类，抗原或过敏原相关蛋白有80条，编码22种蛋白，其中12种具有分泌信号肽，3种具有信号锚定肽。
半胱氨酸蛋白酶(cysteine protease)是许多寄生虫新陈代谢必不可少的，在宿主致病、免疫逃避和组织入侵中都起着重要作用。本研究中通过生物信息学手段在广州管圆线虫EST库中发现三种半胱氨酸蛋白酶家族基因：组织蛋白酶B样基因1，2和血红蛋白酶型半胱氨酸蛋白酶基因(AC-cathB-1，AC-cathB-2,AChem)，分别根据其EST签设计特异引物，通过cDNA末端快速扩增(RACE)技术分别扩增5’和3’端序列，得到基因全长。用生物信息学的方法对三种半胱氨酸蛋白酶样基因进行分析。根据基因全长设计特异引物，对其编码区进行扩增，产物经pnI和SalI双酶切，克隆至表达载体pET32a(+)，转化至大肠埃希菌(Escherichia coli) BL21(DE3)株，以异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达，western-blot检测三种蛋白抗原性。结果显示AC-cathB-1基因全长1311bp，编码394aa，具有分泌信号；AC-cathB-2蛋白也有信号肽，成熟肽由330个氨基酸残基组成；AC-hem全长1460bp，编码386aa，具有分泌信号。AC-cathB-1，AC-cathB-2和AC-hem均有抗原性。
进一步研究以上三种半胱氨酸蛋白酶在广州管圆线虫L1，L3期幼虫和成虫中的表达差异，我们进行了实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)实验。结果显示AC-cathB-1．AC-cathB-2,AC-hem在三期虫体中均有表达，其中AC-cathB-1在L1期幼虫中相对表达量最高，在L3期幼虫体内AC-cathB-2相对表达量最高，在雌成虫和雄成虫体内，分别是AC-cathB-1和AC-hem表达量最高。同一基因在不同发育期的表达量显示，AC-cathB-1和AC-hem基因在发育过程中表达量逐渐增加，而AC-cathB-2在L3期幼虫体内表达量最高，发育成成虫后表达量明显减少。可以看出AC-cathB-1．AC-cathB-2, AC-hem相互协调共同调控广州管圆线虫的发育。
为了快速准确的鉴定鼠类寄生虫，我们针对鼠类常见的三种寄生虫：广州管圆线虫、长膜壳绦虫和短膜壳绦虫，设计了三对特异引物。通过PCR反应，这三对引物均能准确的鉴定三种寄生虫，而且该引物也能在广州管圆线阳性大鼠粪便里面检测出广州管圆线虫，为在野外调查广州管圆线虫的感染情况提供了一个新的方法。