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手足口病是威胁我国婴幼儿生命健康的主要疾病之一。2015年我国手足口病患病人数高达278万。EV71和CVA16是导致该疾病的两种主要病原体，重症病例大多数是由EV71感染引起，CVA16感染者的临床表现较轻。EV71和CVA16感染所致不同的病理过程和疾病严重程度的差异，其背后的机制尚不明确。本组前期的研究发现幼鼠对EV71的易感性与iNKT发育程度有高度相关性。研究发现宿主感染EV71后可以通过Toll样3型受体激活巨噬细胞，进而激活iNKT细胞产生Ⅱ型干扰素，最终控制EV71的病程进展。在接下来的实验中，CD1d和Jα18缺失的小鼠在感染EV71后表现出更高的死亡率和更强的病毒复制，进一步说明了iNKT在EV71抗感染中的重要性。研究还发现人的iNKT也可以被EV71激活，说明iNKT参与EV71的感染过程在人体内也是成立的。CVA16的小鼠感染模型则显示出不同于EV71的干扰素依赖性:宿主产生的Ⅰ型干扰素而非Ⅱ型干扰素对控制CVA16感染更关键。CVA16感染后，先天免疫细胞可以被Toll样3型受体-TRIF信号通路激活进而产生Ⅰ型干扰素。TRIF敲除的小鼠丧失了产生Ⅰ型干扰素的能力，并且病毒也更易入侵和损伤中枢神经系统。外源注射Ⅰ型干扰素可以显著提高CVA16感染TRIF敲除小鼠的存活率。综上所述，EV71和CVA16虽然在序列和结构上有高度相似性，但引起的宿主免疫机制却完全不同，这也许就是同属病毒却会导致疾病严重程度不同的原因。同时研究也指出对不同病原体引起的手足口病应该采取不同的免疫治疗策略。