穿刺巴氏杆菌的分离与鉴定

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根结线虫是一类分布广、危害大、难以防治的植物寄生线虫,严重危害我国与世界的农业生产。穿刺巴氏杆菌是根结线虫的专性寄生菌,在根结线虫防治领域有着广阔的应用前景。为了挖掘穿刺巴氏杆菌资源,本研究从海南岛根结线虫发病区广泛采集样品,从中获取穿刺巴氏杆菌菌株并对其进行鉴定。主要研究内容如下:采集海南19种不同植物的病根及相应根际土样共76份,从6份样品中检测到巴斯德氏芽菌属疑似菌株,编号为PPh01-PPh06,这6株菌的寄主线虫涉及南方根结线虫、爪哇根结线虫、花生根结线虫和象耳豆根结线虫,寄主植物有胡椒和香蕉,相关土壤类型为沙壤土和壤土。分别采用研磨法、石英砂震荡法、超声波法对菌株孢子破壁,结果显示3种方法均能成功提取巴斯德氏芽菌DNA,以石英砂震荡法效果最佳。结合形态学方法与16S rDNA序列分析对6株菌株进行了鉴定,这些菌株与穿刺巴氏杆菌形态相似。进一步将这6株菌的16S rDNA序列与同源性较高的菌株进行系统进化分析,结果显示,在发育树上,这6株菌形成2个主要类群,其中2株(PPh01、PPh06)形成一个类群,与报道的Pasteuria penetrans处于一个分支,与Pasteuria penetransT的16S rDNA同源性为99%,因而将这2株菌鉴定为穿刺巴氏杆菌(Pasteuria penetrans);另4株(PPh02-PPh05)单独形成一另类群,与Pasteuria penetransT的16S rDNA同源性为97%,鉴定为巴斯德氏芽菌(Pasteuria sp.),可能是巴斯德氏芽菌属内一个新的类群。为了对土壤中穿刺巴氏杆菌进行检测,本研究对土壤基因组DNA提取方法进行了改良,并利用巴斯德氏芽菌特异引物对提取的DNA进行了PCR检测,结果显示,氯化钙-核酸提取仪法提取DNA效果最好。应用该方法对土壤中穿刺巴氏杆菌进行检测,土壤中穿刺巴氏杆菌孢子可检测的最低浓度为1000个/g土壤。
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