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目的：通过比较葛根芩连汤有效部位群与其原方对实验性代谢综合征作用的差异，旨在探讨传统方剂与现代方剂作用谱的不同，以期为在传统方剂中寻找适合现代疾病谱的新药提供实验依据和研究思路，从而为经方的二次开发提出一种新模式。方法：采用10％果糖水喂饲建立大鼠代谢综合征模型。根据代谢综合征的诊断标准建立模型及药效评价指标体系，利用药理学、生化学、组织学、分子病理学等方法和手段检测代谢综合征大鼠胰岛素敏感性、血糖、腹部脂肪、血脂等，进行药物作用评价，并进行葛根芩连汤与其有效部位群对MS各组分作用谱及作用强度的比较。检测MS大鼠血清肿瘤坏死因子、皮质醇、C-肽、促肾上腺皮质激素、瘦素及肝细胞胰岛素受体等，分析药物作用部位及作用机理；并探讨葛根芩连汤与其有效部位群对实验性代谢综合征作用差异的可能原因。结果：10％果糖水喂饲6周，模型组大鼠体重显著增加；血糖、甘油三脂升高；胰岛素敏感指数降低。符合MS诊断指征。葛根芩连汤有效部位群高、中、低剂量组显著提高模型组大鼠葡萄糖输注率，降低血糖、皮质醇及瘦素水平，降低腹腔内脂肪重量与体重比值；葛根芩连汤有效部位群中、低剂量组显著降低甘油三酯、FFA及血清胰岛素、TNF-α、C-P、ACTH水平，降低腹腔内脂肪重量，升高肝细胞膜胰岛素受体阳性目标平均灰度；中、高剂量组降低总胆固醇，升高高密度脂蛋白水平；低剂量组显著提高大鼠葡萄糖耐量；中剂量组显著降低体重，改善肝脂肪变性；高剂量组显著降低低密度脂蛋白水平。葛根芩连汤组显著提高模型大鼠葡萄糖输注率，降低空腹血糖、血清FFA、皮质醇浓度，降低腹腔内脂肪重量与体重比值。结论：10％果糖水喂饲6周可成功建立MS大鼠模型。葛根芩连汤有效部位群能提高MS大鼠胰岛素敏感性，改善脂代谢紊乱，降低血糖，减轻腹部肥胖，有效控制MS主要组分。其作用与其能够增加胰岛素受体密度、改善瘦素抵抗、降低体内抗胰岛素激素水平，改善胰岛素受体前及受体缺陷有关。葛根芩连汤通过提高模型大鼠葡萄糖输注率，降低空腹血糖、血清FFA、皮质醇浓度，降低腹部脂肪重量与体重比值，对MS部分组分也有一定的干预作用。但作用机理与葛根芩连汤有效部位群不同。葛根芩连汤与其有效部位群对实验性代谢综合征的作用有明显差异，其原因可能是由于因二者制备工艺不同，药物间的相互作用使各有效成分的配比关系发生变化所致。