大肠杆菌sRNA编码基因yigP结构与功能研究

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yigP基因存在于许多微生物中,其序列都相对保守。在大肠杆菌中,yigP(Gene ID:948915)基因位于辅酶Q合成相关基因ubiE和ubiB之间。GeneBank注释yigP基因是一个可能的蛋白质编码基因,然而却没有任何的文献进一步支持该结论。目前,并未发现有针对该基因的研究报道。   我们前期的研究发现,染色体.yigP基因缺陷的菌株必需通过外源载体提供一个完整的yigP基因才能够生存,因此认为yigP是大肠杆菌生长必需基因。此外,还发现yigP上游区域具有启动子活性。使用RACE技术还确认了yigP转录一个252nt的RNA。   本论文中,我们发现yigP基因下游297bp的片段足以行使相应功能。利用lacZ作为报告基因,我们精确地鉴定了yigP启动子的边界。同时,结合点突变技术,对启动子的-10区和-35区进行了鉴定,以及发现了启动子上游的一个负转录调控序列。最重要的是,yigP基因对移码突变有免疫能力,这说明yigP并非编码蛋白质,而是一个非编码RNA基因。此外,RT-PCR显示yigP能够与其上下游基因ubiE和ubiB共转录。   总之,本研究显示了yigP是一个生长必需的非编码RNA基因  
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