【摘 要】
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许多蔷薇科植物具有重要的经济价值,包括一些重要的果树以及观赏性植物,例如草莓、苹果、梨、桃、月季和树莓。然而蔷薇科植物经常会受到各种逆境胁迫,比如低温、高温、干旱以及病虫害的影响,这严重危害了植株的生长发育以及果实品质。大量研究表明R2R3-MYB蛋白与JAZ蛋白具有互作关系,并且在植物生长发育、代谢机制的调节过程以及植物响应生物和非生物胁迫反应中发挥重要作用,还可以调控相关功能基因的表达、增强植
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许多蔷薇科植物具有重要的经济价值,包括一些重要的果树以及观赏性植物,例如草莓、苹果、梨、桃、月季和树莓。然而蔷薇科植物经常会受到各种逆境胁迫,比如低温、高温、干旱以及病虫害的影响,这严重危害了植株的生长发育以及果实品质。大量研究表明R2R3-MYB蛋白与JAZ蛋白具有互作关系,并且在植物生长发育、代谢机制的调节过程以及植物响应生物和非生物胁迫反应中发挥重要作用,还可以调控相关功能基因的表达、增强植物抗逆性。目前R2R3-MYB基因家族在多个物种中的比较分析以及进化关系研究尚少。随着草莓(Fragaria vesca)、苹果(Malus domestica)、梨(Pyrus communnis)、桃(Prunus persica)、月季(Rosa chinese)和树莓(Rubus occidentalis)六种蔷薇科植物的全基因组测序结果公布,对R2R3-MYB基因家族进行研究分析提供了条件。本文的主要研究内容和结果如下:1、在本研究中,在6种蔷薇科物种中共鉴定出了 1221个R2R3-MYB基因(草莓中163个、梨中281个、苹果中285个、桃中165个、月季中158个、树莓中169个)。系统进化分析表明,进化树中包括73个物种特异性复制进化枝,其中具有153个基因成员,还包括44个世系特异性复制进化枝,其中具有275个基因成员。R2R3-MYB基因不均匀地分布在这六种蔷薇科物种的所有染色体上,并存在少量串联重复事件。根据Ks值的分布,可以看出在苹果和梨中,Ks值在0.1到0.2之间达到峰值;在月季和树莓中Ks峰值出现在0.8到0.9的范围内;而桃中的Ks峰值出现在0到0.1和0.9到1.0两个范围内。此外,大多数R2R3-MYB基因的Ka/Ks值小于1,表明它们的进化主要是通过纯化选择驱动的。基因本体(GO)分析发现草莓和树莓中的R2R3-MYB基因相比于另外四种蔷薇科物种基因具有更大的差异,草莓转录组数据分析得出草莓R2R3-MYB基因在果实生长中起关键作用。2、本研究在森林草莓中鉴定出13个JAZ基因,并在森林草莓中预测了 6对R2R3-MYB-JAZ互作蛋白。此外,对森林草莓中R2R3-MYB-JAZ互作蛋白在不同组织和器官中的表达数据做了进一步分析,并分别计算了各个基因对的皮尔逊相关系数,发现 mrna03712/mrna12541、mrna03712/mrna12975、mrna25149/mrna12541 和mrna25149/mrna12975这四对互作蛋白的表达水平显著相关(P<0.01),这表明在功能上该四个互作蛋白对比较保守。
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