【摘 要】
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小菜蛾颗粒体病毒(Plutella xylostella granulovirus,PlxyGV)是β-杆状病毒属成员之一,对小菜蛾具有强致病性。商业化生产的PlxyGV杀虫剂已经投入大规模应用。为了解PlxyGV在自然状态下的遗传稳定性,本研究完成了对三个PlxyGV分离株的全基因组测序和杀虫活性分析。(1).利用二代测序技术完成了对PlxyGV三个分离株PlxyGV-W(武汉株)、PlxyGV
【基金项目】
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国家重点研发计划课题(项目编号:2017YFDO200404);
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小菜蛾颗粒体病毒(Plutella xylostella granulovirus,PlxyGV)是β-杆状病毒属成员之一,对小菜蛾具有强致病性。商业化生产的PlxyGV杀虫剂已经投入大规模应用。为了解PlxyGV在自然状态下的遗传稳定性,本研究完成了对三个PlxyGV分离株的全基因组测序和杀虫活性分析。(1).利用二代测序技术完成了对PlxyGV三个分离株PlxyGV-W(武汉株)、PlxyGV-B(北京株)和PlxyGV-WN(新武汉株)基因组的高通量测序,利用PCR和一代测序技术填补断点获得全基因组序列。PlxyGV-W、PlxyGV-B和PlxyGV-WN基因组大小分别为100941 bp、100972 bp和100999 bp。(2).序列分析结果显示:三个分离株基因组都包含有118个≥50个密码子、互不重叠的ORFs和4个同源重复区。PlxyGV-W与PlxyGV-B基因组之间存在330个碱基突变,包括98个转换、60个颠换、173个插入/缺失;其中仅有12处非同义突变,涉及7个ORFs。有6个ORF中的非同义突变位点存在序列多态性(orf20除外)。PlxyGV-W与PlxyGV-WN基因组之间存在730个碱基突变,包括337个转换、131个颠换、262个插入/缺失;其中包含70处非同义突变,涉及47个ORFs。其中10个ORFs中的12个非同义突变位点存在序列多态性。(3).PlxyGV-W、PlxyGV-B和PlxyGV-WN基因组与已见报道的另外六个PlxyGV分离株基因组序列的对比分析结果显示,PlxyGV-W与PlxyGV-B和PlxyGV-WN基因组序列相似度分别为99.66%和99.28%。除南非分离株PlxyGV-SA外,另外八个PlxyGV分离株之间的序列相同度均为99%以上;PlxyGV-SA与其它PlxyGV分离株基因组序列相同度分别为98.13-98.53%。除日本分离株PlxyGV-J以外,其它八个分离株基因组包含的预期蛋白质编码ORF数目相同。其中15个ORFs为PlxyGV特有。(4).从PlxyGV-WN感染的小菜蛾幼虫中提取总RNA反转录,目前完成了对11个PlxyGV特有ORFs转录产物的RACE分析,结果显示大部分ORFs只有一个转录起始位点和一个多聚A化位点;ORF56、ORF109有2个转录起始位点;ORF27有3个转录起始位点。(5).用PlxyGV三个分离株对小菜蛾二龄幼虫的生物测定实验结果显示,PlxyGV-W、PlxyGV-B和PlxyGV-WN对小菜蛾幼虫的半数致死浓度分别为1.695-2.300×107 OB/mL、1.570-2.375×107 OB/mL 和 3.131-5.038>×107 OB/mL。PlxyGV-W与PlxyGV-B之间的差异在误差范围内;而PlxyGV-WN与PlxyGV-W和PlxyGV-B之间的差异有显著性。用1×109 PIB/mL浓度的PlxyGV-W、PlxyGV-B和PlxyGV-WN病毒悬液分别感染二龄小菜蛾幼虫测定的半数生存时间为120 h左右,差异不显著。
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