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改革开放以来，我国高等教育领域最令人瞩目的事件就是民办高校的恢复和发展壮大。在民办高校发展的二十几年中，产权及其运行机制问题一直是困扰民办高校发展的深层次问题。民办高校发展的过程也是其在产权制度方面不断突破和创新的过程。从产权制度入手，探讨民办教育体制的改革，是当前教育经济领域研究的热点。运用科斯创立的新制度经济学理论，研究民办高等学校的产权制度及其运行机制，可以从一个全新视野考察我国民办高等教育体制的改革。本文主要运用产权理论和方法，分析我国民办高校的产权制度，阐述民办高校产权明晰和多元化的改革趋势，在此基础上，构建民办高校产权运行机制，以期在这一领域做出新的探索。
全文共分五部分：
第一部分，阐明民办高等学校产权研究的现状及其研究目的和意义，并提出本研究所要解决的问题。
第二部分，阐明民办高等学校产权确立的理论依据，分析民办高校产权的界定、性质、特点和作用。
第三部分，阐述民办高等学校产权变革的趋势：产权明晰和产权多元化及其实现途径，重点分析通过产权主体多元化解决民办高校经费短缺问题。
第四部分，着重从宏观调控机制、内部治理机制、产业运行机制三方面来构建民办高校的产权运行机制；重点分析民办高校内部管理体制中的“家族化”问题、委托代理关系中的机会主义问题及民办高校的产业性及其运行模式。
第五部分，得出本研究主要结论并提出对策建议。健全的教育产权制度是民办高校全面、协调、可持续发展的制度保证，也是解决民办高校体制改革中一些深层次问题的关键。在民办高校产权制度及其运行机制构建方面：一要加强民办高校的立法和行政管理的力度，理顺政府与民办高校的关系，为其发展创造一个有利的宏观环境；二要通过建立健全民办高校内部法人治理机制，完善民办高校董事会制度，以保证其健康稳定的发展；此外，民办高校要充分利用产业运营机制，通过与市场或企业之间信息、资金、人员等办学资源的交流，实现自我发展。