中医不同体质类型与HLA-II类基因相关性研究

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该文对中医体质学说的七种不同体质类型进行了HLA-Ⅱ类基因多态性分布研究,首先按照中医四诊合参原则,制订体质调查表,然后在广东汉族人群中随机选择一般体检无阳性病变人群作为实验对象,各体质类型收入100余例,应用PCR-SBT方法进行HLA-DPB1,HLA-DRB1,HLA-DQB1的基因扩增与分型,根据得到的不同体质类型的不同基因分型数据进行统计学分析.结果显示,DPB1与中医体质关联很小,而DR、DQ与之关联较大.综合来说,阴虚质与DPB1*0501、DPB1*02012、DRB1*13021、DQB1*06011-06013、DQB1*03032、DQB1*06041、DQB1*0609关联;气虚质与DRB1*11011、DQB1*03032、DQB1*06041关联;湿热质与DRB1*11011、DRB1*13021、DQB1*06041、DQB1*0609、DQB1*05011关联;阳虚质与DRB1*11011、DRB1*13021、DQB1*06041关联;瘀血质与DRB1*15011、DRB1*04051、DRB1*1405、DRB1*14071、DQB1*05021、DQB1*03032关联;痰湿质与DRB1*09012、DRB1*11011、DQB1*03032、DQB1*05011关联.在对样品DPB1测序分型的过程中,我们发现DPB1不明确杂合子的问题非常严重,直接影响到结果的分型统计.在946例样品中,结果呈不明确杂合子的总共353例,共计30种类型,占样品总数比率高达37%.为了快速而有效的解决这个问题,该文设计出一套SSP分型解决方案.该方法采用6条上游引物与15条下游引物,使用同一套扩增体系与两套循环反应条件,只需一次PCR扩增,就可以很方便快捷的准确分辨出样品的基因型.另外在这些样品中,有3个样品的测序结果,与现有的多态性数据库无法匹配.经过克隆验证,它们是未曾发现过的新HLA等位基因.这3个基因前两个已经向WHO命名委员会提交并获得命名,分别为HLA-DRB1*0449,HLA-DPB1*0102,第三个已向GeneBank提交,获得注册号AY619719,基因命名正在申请中.与HLA-DRB1*0449最相近的是HLA-DRB1*0406.两者碱基序列几乎完全相同,只是HLA-DRB1*0449第二外显子第18位碱基由G变为A.它导致了成熟蛋白分子DR β链11位氨基酸残基由V(Val,颉氨酸)变成Ⅰ(Ile,异亮氨酸).而DPB1*0202与DPB1*0102最为相似,只有一个碱基的区别(第二外显子192位由G替换成A).这造成DPB1成熟蛋白分子DP β链69位氨基酸残基由E(Glu,谷氨酸)变成K(Lys,赖氨酸).与DQB1新基因(AY619719)最相似的是HLA-DQB1*0201和HLA-DQB1*0202,只有一个碱基的区别(第二外显子第167位碱基由C突变成T),而这个突变是一个同义突变,它并没有对最终的蛋白结构造成任何影响.
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