突变状态和负荷对较低危骨髓增生异常综合征预后的影响

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研究目的:尽管由国际预后评分系统(International Prognostic Scoring System,IPSS)定义的较低危骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)患者总体上预后良好,但仍有一部分患者实际生存时间较短。本研究旨在探究基因突变状态和突变负荷对较低危MDS患者预后的影响。研究方法:对2011年2月至2018年1月期间就诊于浙江大学医学院附属第一医院的159名较低危MDS患者(IPSS评分≤1.0)进行随访和回顾性分析。所有纳入的患者都在治疗前接受染色体核型分析以及15项MDS相关基因的二代测序检测。单因素分析探究基因的突变状态与总生存时间(overall survival,OS)的关系。R语言在线网页工具Cutoff Finder分析基因突变的变异等位基因频率(variant allele frequency,VAF)与OS的关系。将单因素分析P<0.05的突变因素、性别、年龄以及IPSS模型纳入多因素COX回归模型。根据多因素分析的结果,构建一个新的较低危MDS患者的预后评分模型。研究结果:单因素分析提示ASXL1(P=0.001)、RUNX1(P=0.031)、EZH2(P=0.049)、TP53(P=0.016)、SRSF2(P=0.046)、JAK2(P=0.040)和IDH2(P=0.035)的突变状态与预后明显相关。运用R语言在线网页工具Cutoff Finder,发现17.6%(接近18%)的调整后的TET2 VAF值是区分患者预后的最佳VAF临界值(P=0.029;HR=2.12,95%CI:1.06-4.21)。与调整后的TET2 VAF值<18%或TET2野生型的患者(TET2突变低负荷)相比,调整后TET2 VAF值≥18%的患者(TET2突变高负荷)预后明显更差(中位OS:20.4个月VS 47.8个月;P=0.020;HR=2.183,95%CI:1.129-4.224)。多因素COX回归分析结果提示在调整IPSS之后,ASXL1突变型(P<0.001;HR=4.306,95%CI:2.144-8.650)、TP53突变型(P=0.004;HR=4.863,95%CI:1.662-14.230)、JAK2突变型(P=0.002;HR=5.466,95%CI:1.848-16.169)以及调整后TET2 VAF值≥18%(P=0.008;HR=2.492,95%CI:1.273-4.876)均具有独立预后意义。并且发现携带上述不良预后突变因素的数目越多,患者的预后越差(P<0.001)。将多因素COX回归分析中具有独立预后意义的5个风险因素(IPSS中危-1风险、ASXL1突变型、TP53突变型、JAK2突变型以及调整后TET2 VAF值≥18%)整合,构建一个新的较低危MDS患者预后评分系统。新的评分系统将较低危MDS患者分成预后显著不同的三组(P<0.001),并可以识别出10.1%(16/159)不能被目前常见的预后模型所识别的真正高危患者。研究结论:在较低危MDS患者中,ASXL1突变型、TP53突变型、JAK2突变型以及调整后TET2 VAF值≥18%是具有独立预后意义的分子生物学预后标志。将MDS相关基因的突变状态和突变负荷与IPSS模型整合可以对较低危MDS患者进行更精确的风险分层,并识别其中的真正高危患者,使其接受更积极的治疗。
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