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南海北部海区具有复杂的生态环境特征，既有富营养的河口及陆架上升流区，又有寡营养的开阔海区，海区物理过程复杂(上升流、冲淡水、涡旋、黑潮等)多变，对海洋生物生产过程有着较大影响。国内外关于南海基础生产力的大面积实测资料不多，且对生物生产过程对物理过程的响应情况的研究尚不深入。本文基于现场实测资料，研究了以下三方面的内容：(1)南海北部初级生产力的地域多样性及其影响因素；(2)南海北部细菌生产力空间分布及其影响因素；(3)南海与其它低纬度海区基础生产力的比较。本文主要研究结果如下：
1.珠江冲淡水区叶绿素α和初级生产力水平较高，并常常在冲淡水区出现叶绿素α高值。2009年9月，在珠江口东侧10m水深处出现叶绿素α高值，且水柱初级生产力高达1500.53 mgCm-2d-1。
2.粤东和琼东上升流改变了沿岸水体的温度、盐度和营养盐特征，提高了浮游植物生物量和初级生产力水平。2008年7月，在粤东上升流区现场观测到了藻华，表层潜在初级生产力最高值达44.2mgCm-3h-1，水柱初级生产力最高值达6601mgCm-2d-1，浮游植物密度最大可达1.58×106 ind L-1。
3.吕宋海峡附近，黑潮水入侵和涡旋对基础生产力有较大影响。2009年9月，台湾岛西南部海域上层水体下沉，次表层叶绿素α最大值处的浓度较前两年下降明显。受黑潮影响，2009年真光层内叶绿素α较前两年的平均值降低了18.95％，100-150m水柱中叶绿素α降低了37.89％。与中部深海区相比，吕宋海峡西侧水体明显呈高温寡营养特征，证实了黑潮入侵显著影响了吕宋海峡水体性质。
4.南海北部浮游植物粒径结构有着巨大的空间差异。吕宋海峡西侧浮游植物以微微型浮游植物为主(84％)，其次是微型浮游植物(10％)和小型浮游植物(6％)；而在北部陆架区，从沿岸向开阔海域，微微型浮游植物在浮游植物群体中的比重越来越高，说明浮游植物群落结构发生了显著变化。
5.夏季南海北部表层细菌生产力整体上由近岸向深海逐渐降低。温度和营养盐不是影响南海北部细菌生产力的主要因素，细菌生产力与浮游植物生物量及初级生产过程密切相关。水柱细菌生产力与初级生产力的比值(IBP：IPP)的平均值为67.55％，IBP：IPP比值在深海海域明显高于近岸水域，且在吕宋海峡附近水域发现了IBP：IPP>100％的高比值区，说明异养细菌在南海寡营养海域碳循环体系中的重要生态作用。
6.在三个海区的对比中，阿拉伯海初级生产力最高，孟加拉湾最低，南海介于两者之间，并且三个海区初级生产力的影响因素各有不同。在阿拉伯海，初级生产力主要与上升流、垂直混合、水体交换有关，常年保持较高的生产力水平。南海北部生境复杂，初级生产力主要受物理过程影响(涡旋、上升流、黑潮、台风、冲淡水)。强大的径流和高温导致孟加拉湾水体层化明显，营养盐无法到达表层，且多云天气和水体悬浮物限制了浮游植物对光的利用，初级生产力水平较低。