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谱系地理学(phylogeography)是研究栽培作物及其野生近缘种居群遗传结构和进化历史的重要工具之一。通过谱系地理学研究能够有效地了解作物野生近缘居群的进化过程以及重建作物的驯化历史。茄子(Solanum melongena L.)是世界性的重要蔬菜作物,尤其是在中国、印度等亚洲地区。尽管已有不少关于茄子的研究,但迄今为止还没有研究对野茄(S.insanum L.)的居群遗传结构和进化历史进行探讨,茄子的驯化问题也没有得到很好地解决。本研究对茄子及其野生近缘种进行了谱系地理学初步研究,揭示了野茄的遗传多样性水平及地理分布格局,并探讨了中国茄子的驯化起源问题。 首先通过预实验对基因片段进行了筛选。共筛选了19个叶绿体片段和4个核基因片段,最后选取了变异位点最多的2个叶绿体间隔区片段rps16-trnQ和trnV-ndhC,它们的变异率分别为1.9%和1.7%。因此,最后采用了这两个片段来进行野茄的谱系地理学研究。 然后对野茄和茄子共217个个体的rps16-trnQ和trnV-ndhC片段进行了测序:野茄包括21个居群(中国16个,印度5个)共170个个体,茄子包括31个中国个体及8个印度个体,非洲野茄8个个体作为外类群。茄子和野茄相比,其遗传多样性下降了约39%,这可能是由驯化瓶颈效应造成的。野茄居群间存在显著的遗传分化(FST=0.6283)表明它们之间的基因交流有限。野茄居群间的遗传距离与地理距离显著相关,相近的单倍型分布在同一个或地理上相近的居群中,居群随地理距离的增加发生越来越大的分化。 研究结果表明,中国为茄子的可能驯化起源地,原因如下:(1)中国地区的野茄包含有茄子的单倍型;(3) Structure聚类分析显示,所有的茄子均和中国的野茄居群聚合在一起;(3)中国地区野茄居群具有较高的遗传多样性;(4)中国地区具有连续的关于茄子驯化过程的历史文献记载。