橡胶树胶孢炭疽菌CgATG4和CgATG8基因的克隆与功能初步分析

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天然橡胶(Hevea brasiliensis)是一种重要的工业原料和不可缺少的战略物资。橡胶种植业是我国热带地区重要的支柱产业和优势产业。由胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)引起的橡胶树炭疽病是当前橡胶生产上最为严重的叶部病害之一,影响干胶产量损失达7-45%。至今,国内外对该病菌分子致病机理的研究报道极少,克隆和鉴定该病菌致病相关基因,选育抗性品种和创新防治策略,是产业发展中亟待解决的植保问题。本研究是在前期已建立的橡胶树胶孢炭疽菌HBCg01菌株T-DNA插入突变体库的基础上,建立HBCg01菌株突变体筛选方法,筛选获得致病性缺陷突变株CG1988,通过Tail-PCR技术分离获得CG1988突变株T-DNA插入位点侧翼序列。同时,结合HBCg01菌株的全基因数据库,通过本地Blast程序分离克隆了T-DNA标记基因CgATG4基因,并利用同源克隆法克隆了同时参与细胞自噬过程,与CgATG4功能密切相关的CgATG8基因;获得CgATG4和CgATG8基因敲除突变株,并对敲除突变株进行表型分析。获得以下主要研究结果:以中度感病品种——热研7-33-97为致病缺陷型突变体筛选寄主,建立HBCg01菌株突变体筛选方法:以无伤口、古铜色叶期的热研7-33-97叶片为接种材料,初筛接种带菌琼脂块,获得的致病缺陷菌再用孢子悬浮液接种重复验证。从4128个胶孢炭疽菌T-DNA插入突变转化子中筛选得到165个致病缺陷突变菌,再接种孢子悬浮液做三次重复致病性测定,筛选到32个致病缺陷突变菌。利用Tail-PCR技术分离获得CG1988突变株T-DNA插入位点侧翼序列。生物信息学分析表明:CG1988突变株T-DNA插入基因与细胞自噬相关基因CgATG4高度同源;CgATG4基因ORF大小为1129bp,CDS大小为960bp,包含3个外显子和2个内含子,含有一个完整的开放阅读框(ORF),编码319个氨基酸残基,分子量约为35.01kD,含有一个高度保守的peptidase_C54半胱氨酸蛋白酶结构域。利用同源克隆法克隆了同参与细胞自噬过程,与CgATG4功能密切相关的CgATG8基因。生物信息学和分子分析发现,CgATG8基因在基因组中为单拷贝,其ORF为600bp,CDS为366bp,包含3个外显子和2个内含子,含有一个完整的开放阅读框(ORF),编码121个氨基酸残基,分子量约为14.04kD,含有高度保守的GABARAP蛋白酶结构域。构建CgATG4和CgATG8基因敲除载体,利用同源重组技术获得两个基因的敲除转化子:△CgATG4和△CgATG8。对△CgATG4和△CgATG8敲除突变体表型分析发现:△CgATG4和△CgATG8在PDA和CZAPEK培养基上气生菌丝量明显减少,生长速度与野生菌相差不大,产孢量明显减少:孢子萌发及附着胞形成明显延迟,附着胞膨压下降显著;对营养胁迫较为敏感,细胞自噬过程受阻;致病力较野生菌明显减弱。
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