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随着在经济全球化程度日益加深,我国改革开放的不断深入,人们逐渐发现世界经济正转向以知识经济为主导的模式,知识和技术对经济增长的贡献己经超过资本、劳动力和自然资源的贡献,成为最主要的经济增长因素,经济的增长比以往任何时候都更加依靠创新与科技进步。县域科技创新系统是区域科技创新系统的重要组成,把整个县域看作是一个有机的科技创新系统,建设县域科技创新系统,科技创新系统中各行为要素在协同科技创新的过程中,各自发挥着不同的作用,不仅是构建区域科技创新系统和国家科技创新系统的迫切需要,更是提升我国经济发展的质量,推动我国县域经济实现可持续发展的内在要求。在这个系统中,地方政府凭借其特殊的身份完成其他创新要素无法实现的系统功能。由此,我们必须认清地方政府在县域科技创新系统中的行为,对地方政府行为进行准确定位,核心在于地方政府创造一个有利于企业创新的环境和氛围,促进行政区域内有创新能力的企业普遍的、持续的、富有效率的实现创新,以确保科技创新系统的良性运转,从而推动本地区科学技术进步和结构升级,提高经济发展质量和竞争力,促进县域经济健康、持续、快速发展。在我国,目前与市场运行相联系的各种竞争机制以及相关的法律制度等尚未建立和发育完全,政府尤其是地方政府将在县域科技创新系统中扮演十分重要的主导性角色。但由于我国政府在县域科技创新系统的作用方面的研究经验比较少,政府作为党和国家各项方针政策实施的组织者,在行动时正确定位、并在工作领域内以适当的工作方式发挥作用非常关键。随着市场经济机制的完善,制度的进一步转型,中央政府财权和事权的逐步下放,并把某些科技创新活动让渡给地方政府,地方政府的角色进一步发生了改变,财权和事权有了很大的改善,这更使地方政府的行为显得重要,即要积极介入科技创新活动,深化改革,在充分发挥市场基础性配置作用的基础上,正确发挥政府的职能作用可以使不同类型的科技创新行为整合为一个有机的整体以通过相互之间的协同产生最大的创新绩效,使地方经济又好又快的发展。本文以H县为例,通过大量的资料搜集汇总从H县政府的科技创新职能机构建设、政策投入情况、政府财政对科技的支出情况、政府的科技服务工作情况、产学研合作情况几个方面介绍H县科技创新系统中政府行为；再次提出县域科技创新系统中政府行为贡献率的评价指标遴选的原则,构建起县域科技创新系统中政府行为贡献评价指标,并评价体系进行测试和确定,同时,通过对数据的处理,确定指标的内容和权重,分析H县科技创新系统发展中地方政府行为贡献。最后,对H县地方政府在科技创新系统中的政府行为现状进行分析评价,指出其存在的不足。选取具有一定代表性的县域和地区科技创新系统为例,阐述其中地方政府的行为,通过对其他地区科技创新系统中政府行为模式介绍,进而为地方政府提升县域科技创新能力提供可行的对策和建议。