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海绵动物是后生动物谱系演化中分支最早的门类，可能含有所有现生动物的祖先。但是，海绵动物的早期演化历史至今仍有争议。按照以往惯例是把化石海绵按其骨针形态及排列方式直接与现生海绵对比归类，但这方法并不能完全解释所有的化石海绵。在博士后工作期间，本人的研究主要是重新检视早期海绵的化石标本，描述并增加新的特征如骨针内部结构及成分来更进一步地厘清主要化石海绵相互之间的关系。研究结果提供了初步的海绵谱系演化框架，包括现生海绵纲的干群(stem group)和已灭绝的演化世系(lineage)，并且用重大生物特征改变来校正海绵演化生命树的分支时间。网针海绵(Reticulosa)的新定义是代表主要的硅质海绵的千群如六射海绵(hexactinellid)和寻常海绵(demosponge)的干群以及所有海绵的干群。异射海绵(Heteractinida)包括至少钙质海绵(Calcarea)和同骨海绵(Homoscleromorpha)，并且可能囊括多孔动物(Porifera)的干群和硅质海绵(Silicea)的干群基部。原始单轴骨针海绵(Protomonaxonida)在此认为是一个复系群，包括寻常海绵纲(Demospongiae)的基部属种和一到两个已灭绝的、在海绵演化树上更古老的演化世系。
对已报道的前寒武纪海绵的回顾研究中发现，有些许已发表的图例暗示了海绵存在于寒武纪之前的可能性，但应该要比现有的依迪卡拉系化石记录更为丰富。根据寒武系早期荷塘组生物群的微型海绵表示前寒武纪海绵的稀缺性可能是因难以在薄片上及酸处理后获得的标本鉴定埋藏过程中发生重大变化的海绵化石骨针而致。因此，保存环境上的偏向于湍流环境再加上海绵个体整体偏小、保存潜力低等因素影响了依迪卡拉系化石海绵的记录。
近年来，早古生代海绵生物群的数量有渐增的趋势，但海绵的宏演化模式却引起歧义并且相互矛盾。基本上，从奥陶系早期之后，网针海绵就大抵出现在偏深水或是贫氧的环境中，并且逐渐取代原始单轴骨针海绵原本的生活环境。而且，原始单轴骨针海绵也自此之后大规模地消失。但在华南板块附近的海域，一直到志留系早期都有大型骨针的原始单轴骨针海绵的化石记录，在化石海绵群落里占有重要的生态地位。