通过DGE方法找出小鼠癫痫调节相关基因

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癫痫是目前世界上最常见的疾病之一,尤其在发展中国家中造成重大危害。然而,癫痫的病理机制尚未完全清楚。在这项研究中,我们对小鼠癫痫模型进行了多组学研究,包括转录组,小RNA组和蛋白质组。小鼠模型包括:正常组、MES诱导的癫痫组和通过五种药物治疗后恢复正常三组。五种药物包括:文拉法辛、氟西汀(FT)、卢非酰胺(RF)、Q808和J601。前面三种药物是世界上治疗癫痫的主流药物。最后两种药物Q808和J601是通过实验室合成的新药物,经过验证也具有良好的效果。对正常小鼠和癫痫小鼠的差异表达基因数据做韦恩图分析,发现有4个mRNA存在于所有的癫痫/正常小鼠的差异表达中,包括:SNCA、DLGAP4、AHSP、CORO1B。我们选取了Control、Efexor50和MES三组,对它们进行了蛋白质组学ITRAQ验证,我们发现只有一个基因SNCA被验证。该基因是与神经元细胞多巴胺的释放和运输相关,以及与细胞凋亡应答相关。我们还检测了Control、Efexor50和MES三组小RNA,并且与转录本的数据进行关联预测了3个与SNCA相关的miRNA,其中一个miRNA MMU-MIR-21A-3P在癫痫小鼠和正常小鼠中变化了27倍,并且趋势和SNCA相反。SNCA在癫痫小鼠的转录本数据中显示下调,而MMU-MIR-21A-3P在癫痫小鼠中呈现上调。两者相反的趋势对说明这个小RNA在调节SNCA中很有可能起到了重要的作用。这些发现将有助于人们更好地了解癫痫和以及为癫痫的治疗提供了新的靶点。
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