【摘 要】
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羊草(Leymuschinensis(Trin.)Tzvel.)，是多年生的禾本科赖草属牧草，是我国内蒙古东部草原和东北草原植被中的优势种。羊草环境适应性较强，耐寒、耐旱、耐盐碱等;同时，羊草是一种
【出 处】
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中国科学院研究生院 中国科学院大学
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羊草(Leymuschinensis(Trin.)Tzvel.)，是多年生的禾本科赖草属牧草，是我国内蒙古东部草原和东北草原植被中的优势种。羊草环境适应性较强，耐寒、耐旱、耐盐碱等;同时，羊草是一种重要的饲用牧草资源。刈割和放牧是羊草等草原牧草的主要利用方式，在草畜互作的长期过程中，羊草产生了适应放牧的机制，目前对羊草响应放牧的分子机制研究较少。开展对模拟放牧下羊草转录组的测序分析有助于认识羊草响应放牧的分子机理。本研究利用高通量测序技术，对羊草模拟放牧中涉及的创伤、去叶和动物唾液成分三种胁迫进行了转录组测序分析。取得了如下结果:
采用Solexa技术对5-6叶期羊草进行创伤、刈割和刈割后涂抹BSA三种处理后2h，6h和24h的材料进行转录本测序，将获得的测序数据与本实验室已有的454测序结果进行比对，获得了各处理差异表达的基因，响应创伤、刈割和BSA三种处理的基因群分别有1836个、3238个和2337个。与创伤相比，特异响应刈割的基因群有2483个;与刈割相比，特异响应BSA的基因群有1289个，通过比较三种处理诱导的差异基因在数量、功能和表达趋势上的不同，说明在放牧过程中，创伤、刈割和BSA处理引起的基因表达行使不同的作用。
运用GO功能、GO富集、KOG和Pathway等分析方法重点对特异响应创伤和刈割的差异表达基因进行了分析，在特异响应刈割的2983个基因中，有1557个参与GO注释，匹配到KOG数据库上的共有1756条，参与KEGG分析的有634条;特异响应创伤的基因有925个，其中有412个参与GO注释，匹配到KOG数据库上的共有463条，参与KEGG分析的有153条。利用KEGG工具对特异响应创伤和刈割的差异表达基因进行了Pathway分析。还发现创伤处理下脯氨酸代谢途径中涉及脯氨酸合成的基因明显上调，推测创伤处理引起了脯氨酸的积累。
本研究关注了放牧过程中的几个重要环节，将放牧过程分解并比较分析了不同处理对羊草的不同影响，本研究还提供了运用测序技术和生物信息学方法研究非模式植物的经验和做法。
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