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辣椒病毒病(CMV)是辣椒生产上的重要病害之一，发病速度快，药剂防治的效果差，深入研究辣椒对CMV的抗性生理生化机制，选育抗病材料是控制此病的重要措施之一。本试验采用人工苗期接种鉴定的方法，筛选了7个抗性不同的辣椒品系，测定分析了7个品系在接种前后的防御酶活性(POD、PPO、PAL、SOD)、可溶性蛋白、木质素、总酚、游离氨基酸、游离脯氨酸、可溶性总糖含量与抗病性的关系。并通过双列杂交Griffing和六世代联合分析法分析研究了辣椒抗CMV的遗传规律。结果表明：
1、接种CMV前，除可溶性总糖含量与抗病性呈负相关外，其它指标与抗病性不相关，品系间差异不显著。辣椒感染CMV后，防御酶活性、可溶性蛋白、木质素、总酚的相对或绝对含量在不同时间内与品系的抗病性有很好的相关性，游离氨基酸、可溶性总糖、游离脯氨酸的绝对含量与抗病没有相关性，相对含量与抗病性有很好的相关性。各项生理生化指标的变化，可以区分各品系间抗病性的差异，对于探索其抗病机理，筛选用于抗病育种的生理生化指标具有一定的理论意义。
2、病情指数的一般配合力在-9.47-13.86之间，其中r1、r2和r4的一般配合力效应最好，特殊配合力在-25.09-20.01之间，亲本r1、r2、r4之间组合的特殊配合力大于亲本r1、r2、r4和s1、s2、s3之间组合的特殊配合力。
3、通过6世代联合遗传分析，辣椒抗CMV遗传符合一对加性基因+加性—显性多基因模型，主基因遗传率在B1、B2和F2分别为46.08％、30.59％和61.65％，多基因遗传率在B1、B2和F2分别为0、0.66％和17.82％，环境对辣椒抗CMV的遗传有很大影响。