稻米品质性状遗传分析与QTL定位

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangyuan1984
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随着人民生活水平的不断提高,对稻米品质提出了越来越高的要求。稻米品质包括碾磨品质、外观品质、蒸煮与食味品质和营养品质等,其中外观品质、蒸煮与食味品质以及营养品质备受消费者的关注,是水稻遗传改良的重要目标。由于稻米品质是数量性状,受多基因控制,且容易受环境因素的影响,因此利用传统的育种方法改良这些性状显得比较困难。为了对稻米品质的遗传基础有更全面的了解,更好地利用分子手段来提高稻米的食味品质,本文主要进行了以下4个方面的研究:1.不同环境条件下水稻品质性状的QTL分析利用Koshihikari/Kasalath BIL群体对2006年南京、2007年南京以及2007年海南三个环境的12个品质性状进行QTL检测,共检测到控制稻米品质性状的QTL64个。其中营养品质相关的QTL有15个,外观品质相关的有3个,淀粉粘滞性相关的有46个。在3个环境下同时检测到6个QTL,包括qPI-3-1、qPKV-6、qHPV-6-1、qBDV-6、 qSBV-6-1、qPaT-6、qPGWC-6只在2个环境中被检测到。同时我们利用Koshihikari/Kasalath CSSLs对这7个QTL进行验证和环境稳定性分析。结果证实了这些QTL的存在和环境稳定性。此外,我们还发现各品质位点具有多效性现象,除了与Wx位于同一区间的标记之间检测到控制多个性状的QTL簇以外,还在多条染色体的多个位点上检测到控制RVA的QTL簇,营养品质性状的QTL簇以及两者共同存在的的QTL簇。这些性状间相关性的方向与同一亲本的等位基因对性状的作用方向一致。这种QTL多效性的产生究竟是由基因的一因多效,或者是由紧密连锁的许多QTL的综合效应引起的,还需要通过构建它们的近等基因系进行精细定位和克隆,才能够真正的了解2.稻米品质性状相关QTL的稳定性分析利用2007年南京和金湖两个环境的Sasanishikix Habataki BIL群体对稻米品质10个相关性状进行QTL检测,共检测到43个QTL。其中与蛋白含量相关的QTL有5个,与淀粉粘滞性相关的有38个。在2个环境下同时检测到10个QTL,包括qPC-8、 qAAC-4、qAAC-10、qPKV-2、qPKV-7、qHPV-7、qCPV-1、qBDV-4、qBDV-7以及qSBV-7。同时我们利用Sasanishikix Habataki染色体片断置换系CSSLs对这10个QTL进行验证和环境稳定性分析。结果证实了这些QTL的存在和环境稳定性。此外,我们还发现各品质性状间具有共位点现象,例如第2染色体标记G1340-C499之间,第5染色体标记R3166-708之间,第7染色体标记R2829-R2401之间都存在控制多个品质性状的基因簇。3.不同灌浆时期水稻蛋白积累的动态QTL分析蛋白质含量和蛋白质指数在水稻营养品质中起着重要作用。本研究利用由粳稻品种Asominori和籼稻品种IR24的杂交组合衍生的重组自交系(RIL,71lines)群体,采用非条件和条件QTL定位方法,对水稻四个灌浆时期的蛋白质含量和蛋白质指数进行分析。四个灌浆时期共检测到控制蛋白含量的非条件和条件QTL分别为9个和6个;11个控制蛋白指数的非条件QTL和9个条件QTL被检测到。灌浆前期,灌浆中期和灌浆后期检测出较多的控制PC和PI的QTL。本研究结果表明控制PC和PI的QTL的表达均具有时空特异性。对蛋白含量和蛋白指数的非条件和条件QTL分析中可以检测到两个或三个灌浆时期同时表达的QTL;多数QTL仅在一个灌浆时间检测到。除此之外,有7个QTL与前人报道的成熟时期检测到的位置一致。许多QTL在PC和PI中都能被检测到,与这两者之间具有显著相关性一致。从整个灌浆时期对控制蛋白积累的遗传因子进行非条件和条件QTL分析,可以检测更多的遗传信息。与传统的仅用一个发育时期进行定位的结果比较,不仅提高定位的效率,而且可以更全面地揭示控制稻米蛋白积累的遗传信息。4.大腹白突变体WB的初步定位本研究利用一个具有多向表型的突变体WB,对表型进行深入研究。突变体与野生型日本晴相比,出现大腹白,并且籽粒变大,具体表现为长、宽、厚比野生型日本晴都显著增加。突变体WB的蛋白含量、脂肪含量以及直链淀粉含量都明显提高,千粒重变大。我们利用突变体和籼稻品种Pusher衍生的F2:3群体(550株)对大腹白基因WB进行初步定位,选择到了46株极端隐性个体。利用BSA法,我们发现WB表型与第二染色体的SSR标记RM13061和RM13195具有较好连锁关系,遗传距离为3cM, WB基因的初步定位为进一步研究腹白基因的分子功能提供遗传基础。
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