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在农用地转用中，农用地价值的评估和补偿工作主要局限在对经济价值和社会价值的评估和补偿上。忽略了农用地的生态价值。事实上农用地转用中是土地生态系统作为投资过程中的一项投入，当土地作为固定资本投入建设项目中，土地的利用方式改变了，这必然会导致土地生态系统的生态损失。目前，对农用地生态价值的评估和补偿在国内外的研究都很少，有必要对土地生态价值及其补偿工作进行探究。
本文正是基于上述背景，在综述国内外土地生态价值核算方法研究成果的基础上，运用以比较分析和实证分析为主的研究方法，借鉴资源环境经济学对森林生态系统生态服务功能价值的评估方法，探讨了农用地转用中土地生态补偿价值评估的新思路和方法。并以杨陵区为例，对农用地转用中土地的生态损失价值进行评估，得出相关结论，并提出了土地生态补偿的可行性建议和措施。
论文基本结构和主要研究内容概括如下：
第一章为导论。主要阐述本文研究背景、目的和意义，国内外研究动态及其评价。
第二章为研究的理论基础。资源价值论，指出了农用地除了经济价值、社会价值外，还包含有生态价值；生态服务功能理论，从市场供求和外部性两方面，论证了农用地生态价值存在的合理性，并具体指出了农用地的生态服务功能；补偿理论，是农用地转用中外部性问题得以解决的理论基础。
第三章为土地价值评估现状及存在的问题。通过对土地价值评估现状的分析，得出现有的土地价值评估忽略了土地生态价值的评估。
第四章为农用地转用中土地生态补偿价值的评估。参照森林生态系统生态价值评估的理论和方法，确定了农用地转用中土地生态补偿价值的评价指标，并构建各指标值的计算方法，最后建立计量模型。
第五章为实证分析。对杨凌区农用地转用中土地生态补偿价值进行计算，对计算结果予以分析并得出相关结论。
第六章为结论和建议。给出了论文研究的最终结论，并针对当前土地生态补偿的缺失，提出了可行性建议。
本文得出的主要结论：
(1)农地总价值应等于经济价值、社会价值和生态价值之和。有必要不断完善农地价值的监测和计量方法，建立统一的计量、统计和核算口径，以全面估算农地的综合价值。
(2)给出了农用地转用中土地生态补偿价值的评估方法和评估模型的建立。
(3)建立农地生态价值补偿机制可实现农用地转用外部成本内部化。文章提出了农用地转用中可行的土地生态补偿措施和具体实施方式。