椭圆食粉螨线粒体基因组测序及种群遗传结构的研究

来源 :安徽师范大学 | 被引量 : 6次 | 上传用户:zhaojie25
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椭圆食粉螨(Aleuroglyphus ovatus Troupeau,1878)隶属蜱螨亚纲(Acari)、无气门亚目(Astigmata)、粉螨科(Acaridae),是世界性分布的储藏物螨类。该螨不仅可造成储藏物数量损失,也能导致储藏物品质下降,甚至引起人体螨病。椭圆食粉螨个体小、繁殖量大、生活史周期短;随着储粮防护剂和熏蒸剂的大量、持续使用,耐药性和抗药水平不断提高,增加了其防制难度。目前,有关椭圆食粉螨的研究主要集中在生活史、实验种群生态学及防治等方面,而对椭圆食粉螨自然种群动态、遗传多样性和遗传分化的研究却相对滞后。线粒体基因组全序列的研究可为种群遗传结构研究提供分子遗传标记,但迄今全世界仅测序了2种储藏物螨类的线粒体基因组全序列,而粉螨科物种的线粒体基因组全序列至今未见报道。为此,本研究调查了椭圆食粉螨自然种群季节消长和空间分布型,测序获得了椭圆食粉螨线粒体基因组全序列,并探讨了不同地理、不同季节和不同孳生物椭圆食粉螨种群间的遗传结构,以期为椭圆食粉螨的综合防制提供科学依据。主要研究内容和结果如下:1、自2012年2月至2013年1月,调查芜湖市区的4个采样点面粉中椭圆食粉螨种群的季节消长情况。每月定点采样,进行椭圆食粉螨的鉴定及计数。采用扩散指标、Taylor幂法则及Iwao m*/x回归方程,研究椭圆食粉螨种群在仓库面粉中的分布特征。结果显示:(1)椭圆食粉螨为芜湖市面粉中自然种群消长呈双峰型,7月和9月为种群密度高峰期;(2)在仓库面粉中,椭圆食粉螨自然种群呈聚集分布。基于上述调查结果,可于储藏物椭圆食粉螨种群密度高峰期前期选择适合的防治策略以提高防治效果。2、采用Long-PCR和prime walking等技术,对椭圆食粉螨的线粒体基因组全序列进行测定和分析(GenBank登陆号为KC700022)。结果显示,椭圆食粉螨线粒体基因组长14328bp,具有13个蛋白质编码基因、22个tRNA和2个rRNA以及1个最大的非编码区(LNR),其特点如下:(1)与节肢动物动物祖先类型线粒体基因的排序相比,线粒体基因组有大量的基因重排,涉及蛋白质编码基因和RNA基因的易位和倒位;(2)线粒体tRNA很短,长度在48~62 bp之间(平均54.0±3.39 bp)。22个tRNA基因中,仅trnK的二级结构能折叠形成三叶草结构,其余21个tRNA均为缺乏T-臂或D-臂的非典型结构;(3)线粒体基因组LNR位于trnF和trnSl之间,长378bp,有1个终止相关序列区的核心序列"ACAT",1段类似微卫星的重复序列(AT)n,还发现多个能稳定形成茎环的二级结构,推测其可能是线粒体控制区(control region)。3、联合线粒体rrnL-trnw-IGS-nadl基因和核内核糖体转录内间隔区(ITS)的DNA序列,分析了采自我国7个椭圆食粉螨地理种群的遗传多样性和遗传分化。结果显示:(1)从68个椭圆食粉螨个体中,获得了68条线粒体rrnL-trnw-IGS-nadl基因序列,共定义了17个单倍型;获得的68条ITS序列,共定义了47个单倍型;(2) AMOVA显示,石家庄种群与其他6个种群间的遗传分化达到极显著水平(P<0.01),商丘种群与其他种群间存在显著的遗传分化(P<0.05)。推测椭圆食粉螨种群在自然历史环境中,由于地理隔离以及孳生生境的异质性,导致该螨产生了显著的遗传分化。然而,在芜湖种群和海口种群间以及上海种群和南宁种群间的遗传分化不显著(P>0.05),南宁种群与海口种群间以及上海与金华种群间遗传分化指数FsT为负值,暗示两个种群对的种群间存在高水平的基因流;通过对不同地区的面粉来源调查推测椭圆食粉螨种群间的基因流,很可能借助于粮食贸易等人类活动而产生。(3) Mantel检测显示,椭圆食粉螨各地理种群间的遗传距离与地理距离没有显著的相关性(P>0.05);(4)单倍型聚类和进化网络图分析显示,来自同一地理种群的椭圆食粉螨线粒体rrnL-trnw-IGS-nadl单倍型和核糖体ITS单倍型,均未能聚类在一起。储藏物螨类是一种广泛分布的物种,推测其中的某些单倍型环境适应能力较强,导致分布较广。有关研究尚待进一步开展。4、对芜湖地区5月至9月不同种群增长阶段以及不同孳生物中椭圆食粉螨种群遗传多样性和遗传分化格局进行的分析显示:(1)基于线粒体rrnL-trnw-IGS-nadl基因和核糖体ITS序列的不同季节、不同孳生物椭圆食粉螨种群的单倍型多样性和核苷酸多样性存在差异,可能是由于两种分子标记有着不同的进化速率或者不同的进化模式所致;(2) AMOVA显示,在芜湖地区采集的不同季节、不同孳生物椭圆食粉螨种群间未发现显著的遗传分化(P>0.05);(3)单倍型聚类和进化网络图分析显示,来自同一季节或同一孳生物种群的椭圆食粉螨线粒体rrnL-trnw-IGS-nadl单倍型和核内核糖体ITS单倍型,也未能聚类在一起。基于上述分析结果,在芜湖地区椭圆食粉螨种群的防控中,可以考虑统一的防制策略。
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