拟南芥花药发育相关基因调控关系的预测

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模式植物拟南芥花药的发育过程由一系列复杂的基因调控网络所控制,基因调控网络及特定基因与其它基因的调控关系对于发育分子机理深入研究具有重要的意义。至今为止,由于实验技术的限制,我们对这一调控网络的了解非常有限。 在本项目中,我们利用一种整合基因芯片数据与启动子序列分析的生物信息学方法来预测拟南芥花药发育相关基因之间的调控关系。基于这种方法,一共预测到了7710对具有调控关系的基因对,并利用这7710对共2319个基因构建成了了一个可视化的拟南芥转录调控网络。经过我们的筛选,在这7710对调控关系中有80对为高可信度的调控关系基因对,其中,有三对调控关系已被之前的实验验证。基于以上数据,我们建立了一个与拟南芥花药发育相关的转录调控数据库,其中存储了预测到的拟南芥转录调控关系。这个数据库将有助于拟南芥花药发育分子机理的深入研究,其相关的生物信息学研究方法也为拟南芥的其他基因调控关系研究提供一条可行的途径。
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