【摘 要】
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对染色体进行全序列测定依赖于覆盖大的染色体区估贩高质量物理图的构建.以遗传标记R1427/R2231(122.9-123.8cM)和R2184S(129.6cM)所分别锚标的重叠群(ctg842和ctg816)为起点
【机 构】
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中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所
【出 处】
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中国科学院上海生物化学研究所 中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学
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对染色体进行全序列测定依赖于覆盖大的染色体区估贩高质量物理图的构建.以遗传标记R1427/R2231(122.9-123.8cM)和R2184S(129.6cM)所分别锚标的重叠群(ctg842和ctg816)为起点,采用基于STS的作图策略(STS-contentmapping)进行重叠群延伸,最终构建了覆兽水稻基因组第4号染色体长臂近端粒区约7.3cM(122.3-129.6cM)的一个连续的1.8Mb的可测序BAC克隆重叠群.从重叠群中可挑选出重叠最少的22个BAC克隆进行序列测定.从该文所构建的1.8Mb可测序重叠群中前后一共挑选了22个BAC克隆进行全序列测定.对930Kb完成序列进行了注解.结合软件预测和数据库检索的信息,在930Kb序列中预测了153个蛋白编码基因,平均的基因密度为6.1Kb/gene.MITEs如此广泛、高密度的分布暗示了其在基因组中发挥着很重要的作用.该文对该930Kb序列中所鉴定的一个过氧化物酶基因簇进行了详细的结构分析及进化分析.
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