管家基因及组织特异性基因的鉴别及分析

来源 :中国科学院北京基因组研究所 | 被引量 : 2次 | 上传用户:warewell
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管家基因,在习惯上,指的是那些执行比较基本的功能,如转录、翻译等的基因,而在此指的则是那些在所有的组织里面表达量都比较恒定的基因,而组织特异性基因指的则是那些仅在某种组织里面表达量比较高,而在其他所有的组织里面表达量都比较低的基因。基于微阵列芯片数据,我们得到了正常组织及癌变组织的管家基因及组织特异性基因,并对它们之间的共性及个性进行了比较。我们还对我们所得到的管家基因及组织特异性基因进行了富集分析,我们发现,管家基因所富集到的多为比较基本的功能,而组织特异性基因所富集到的则多为组织特异性的功能,这说明我们的结果是比较可靠的。为了进一步验证我们的结果的可靠性,我们对我们所得到的管家基因在多组疾病数据里面的差异表达情况进行了分析,并挑选出了那些在所有的疾病里面都没有差异表达到管家基因,我们认为,这些基因所执行的应该是那些最为根本的功能。我们还利用我们实验室现有的工具对所得到的管家基因进行了网络分析,并观察了其在疾病中的扰动情况。除此之外,我们还根据基因的差异表达情况鉴别出了几类疾病的易感基因并对转录因子的靶基因进行了富集分析。
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