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现代大学学科制度建设是一项关系学科自身，关系大学、高等教育发展的综合性、全局性及长期性的基础建设，是现代大学必须重视的主要方面。而制度建设是一项系统性工作，实践中需要有代表正确方向的理念做指导，那么从价值、理念层面对学科制度进行分析就很有必要。
本文首先考察了对“学科”、“学科制度”、“学科制度建设”等概念的不同理解，区分了其所属范畴，在对其内涵与外延剖析的基础上，重新定义了其概念，力求形成关于学科制度的整体认识；并对易于混淆的、与学科有关的几组概念进行了比较，总结出作为知识体系的学科和作为研究活动的学科所具有的特点；同时，在分析当前我国学科制度建设存在一些问题的基础上，引出本文的中心论点——现代大学学科制度建设的价值取向。其次，在分析制度建设与价值取向关系的基础上，总结出现代大学在进行学科制度建设时要遵循的基本价值取向：效益性价值追求、适应性价值追求、专注性价值追求、创新性价值追求以及前瞻性价值追求。并对如何在基本价值取向(理念)指导下进行学科制度建设提出了相应对策。