基于缺口酶的链置换等温扩增技术

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核酸检测已经成为生物医学研究不可分割的一部分,到目前为止聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)是这个领域最常用的方法,但往往需要复杂的热循环仪并且反应时间较长。近年来,国内外许多课题组都致力于这方面的研究,建立了许多等温检测的方法。其中链置换扩增技术(SDA)是1992年由Walker等人提出的,为了让限制性内切酶只剪切双链中的一条链获得缺口,他们引入了修饰的底物(dATPαS)以形成修饰的酶切位点,且产物不能用常规的琼脂糖凝胶电泳方法进行检测,因而限制了此技术的应用。本研究解决了这些问题,用缺口酶Nt.BstNBI和Bst DNA聚合酶结合实现了常规底物下的DNA扩增,并且扩增产物可用琼脂糖凝胶电泳方法检测。本方法具有以下特点:  1:等温。等温条件使得该方法的适用性高于PCR且成本比PCR更低,操作更简单,因为既不需要热稳定的酶也不要昂贵的仪器即可达到目的,从而打破空间限制,可以应用到实时的检测中;  2:高特异性。反应需要两对引物的正确延伸和替换,并且扩增还依赖于缺口酶的剪切和聚合酶的延伸的配合,在没有形成缺口酶的识别位点或者没有正确剪切时不能进入下一步的反应,因而具有高的特异性;  3:高效率。整个反应在30min左右即可以完成,反应时间短,能够用于实时快速检测;  4:安全方便。反应产物可以用琼脂糖凝胶电泳直接检测,不需要再用放射性的检测方法,安全性更高且更加方便。  5:本文还初步研究了该种方法下的报告体系,报告体系的进一步完善将使得该方法更方便的用于实际检测中。  综上所述,本文建立了在缺口酶Nt.BstNBI和Bst DNA聚合酶结合下的链置换扩增技术,使得链置换扩增技术设计简便、专一性好、快捷方便。
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