毛竹等36种竹类植物的RAPD分析

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应用随机扩增多态DNA(RAPD)标记,分别对11属35种苦笋竹类植物进行亲缘关系分析,对10个天然居群135个毛竹(Phyllostachys pubescens)样本和两个种源试验地的16个毛竹种源32个样本进行遗传多样性和遗传结构分析。结果如下: 1.筛选了适合于竹类植物RAPD扩增的反应体系:反应总体积10μL,含模板DNA5ng/μL,MgCl2 2.0mmol/L,dNTP 0.2mmol/L,引物0.3μmol/L,Taq DNA聚合酶0.5U。扩增程序:94℃预变性120s;94℃变性30s,40℃复性30s,70℃延伸90s,循环38次;72℃延伸420s,4℃结束。 2.RAPD分子标记对11属35种苦笋竹类植物的分析结果表明:35种苦笋竹类植物可以分为两个区:即丛生竹类区与散生竹和复轴混生竹类区。其中,丛生竹类区属间与属下等级的RAPD聚类结果与形态学分类基本一致;散生竹类、复轴混生竹类以及散生竹与复轴混生竹属问与属下等级的RAPD聚类结果与形态学分类不完全吻合;此外,RAPD分析支持酸竹属(Acidosasa)的粉酸竹(A.chienouensis)与大节竹属(Indosasa)的橄榄竹(I.gigantea)并归一属,同时支持将粉酸竹划归大节竹属。 3.对福建省10个天然居群135个毛竹个体的RAPD分析结果表明:①毛竹种水平的多态条带比率(PPB)为75.47%,Shannon多样性指数(1)为0.2418,Nei’s基因多样度(h)为0.1578,表明毛竹种水平的遗传多样性相当高。10个毛竹天然居群中,寿宁(SN)居群的遗传多样性最高,其次是尤溪(YX)居群,而建瓯-迪口(JD)及龙岩(LY)居群的遗传多样性相对较低;②AMOVA分析表明,68.46%的变异存在于居群间,31.54%的变异存在于居群内,说明毛竹居群间存在极显著的遗传分化:③UPGMA聚类结果将10个毛竹天然居群聚为两大支:一支含武夷山-坳头(WA)、龙岩(LY)、永安(YA)和尤溪(YX)等四个居群,另一支含武夷山.大竹岚(WD)、顺昌(SC)、建瓯-房道(JF)、漳州(ZZ)、寿宁(SN)和建瓯-迪口(JD)等六个居群。 4.对16个种源32个毛竹个体的RAPD分析结果表明:不同种源间存在明显的地理变异。UPGMA聚类结果将16个种源划为两个区:第1区由浙江衢县(6)、广东从化(10)、广东乐昌(9)三个种源组成,第Ⅱ区由其余13个种源组成。第Ⅱ区中,福建的6个种源以北纬27°,东经118°为界聚为两支,即经纬小于118°E 27°N的福建沙县(14)、福建龙海(16)、福建华安(15)3个种源聚为一支,经纬大于118°E 27°N的3个种源[福建武夷(11)、福建松溪(12)、福建建瓯(13)]聚为另一支;剩下的七个种源[湖南株洲(5)、江西九江(7)、江苏句容(1)、江苏宜兴(2)、安徽霍山(3)、湖北武汉(4)、江西上饶(8)]则聚为又一支。
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