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目的：进一了解新疆部分贫困县村卫生室卫生资源配置及使用现状，为提高其资源利用率，达到改善村卫生室环境、提高其服务质量与水平，从而更好的提高村民的身体健康，为卫生管理机构制定相关卫生政策和策略，及东部发达地区对口支援帮扶提供基础资料，推进村卫生室基础设施和能力建设提供实质性依据。方法：采取随机分层抽样方法，从新疆36个贫困县中随机抽取6个贫困县的376个村卫生室进行调查，定量资料利用调查表收集2005年至2011年上报的卫生资源人、财、物相关数据，定性资料收集54个村卫生室相关负责人访谈及年度工作总结。结果：本次调查共有376个村卫生室，已建成标准化村卫生室86个；村卫生室业务用房面积平均达标率为71.06%，房屋建筑面积达到国家标准规定200平方米村卫生室占8.61%，同时拥有观察室、计划免疫室、健康教育室的占18.76%；每千农业人口村卫生室人员数为0.05人，每千农业人口执业助理医师为1.32，每千农业人口注册护士为1.09；性别构成男性与女性比例为63.85%、36.15%；年龄构成以35岁以下年龄者占大多数为57.89%；学历构成以中专学历比例较高为54.82%；执业结构以乡村医生占在岗职工总数的71.39%，执业医师仅占2.74%、执业助理医师数为1.49%；六年间人员培训地区级、县级、乡级医疗机构年平均增长率分别为20.69%、25.13%、39.43%；内容主要以专科、全科为主；村卫生室总收入及总支出从2005年至2011年总体均呈现增长趋势，平均增长率分别为21.89%、24.44%；2011年总收入分布依次为：人员补助经费收入占40.00%、上级补助收入占27.49%、药品收入占22.41%、医疗收入占10.00%；总支出依次为人员支出占61.24%，药品支出占38.36%，其他支出占0.40%；基本医疗卫生服务提供情况显示诊疗人次、出诊人次、转诊人次由2005年至2011年总体均呈现增长趋势，平均增长率分别为9.63%、6.27%、22.80%*；公共卫生提供情况显示报告疑似传染病例数、产后访视次数、五苗计划免疫接种人次、健康档案累计建档人数分别为6.73%、34.18%、16.73%、44.94%，开展健康教育次数总体呈现下降趋势，平均增长率下降24.30%；设备方面检查设备类配置率、使用率均为最高分别为75.65%、65.43%，辅助设备类均为最低分别为21.89%、39.22%。结论：新疆贫困县村卫生室在国家及自治区的政策支持及资金投入下，房屋设备等基础建设已有很大的补充和更新，但村卫生室数量不够、卫生人员数量缺乏素质不高、设备种类少使用率低等现象依然存在，是制约村卫生室卫生服务能力发挥的重要原因，应加强各级政府投入的同时，合理配置贫困县村卫生室卫生资源，重视技术人才的培养，重点解决如何留住卫生技术人才、工资待遇及养老问题，巩固完善村卫生室的基本功能和基础地位，更好地向广大农牧民提供安全有效、方便价廉的基本医疗卫生服务。