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黄檀属隶属于豆科蝶形花亚科黄檀族(Leguminosae: Papilionoideae:Dalbergieae)，全世界约250种，中国产29种。目前对该属很多具有潜在系统学价值的性状研究较少。本文对国产黄檀属的形态学和分子系统学进行了研究。
对中国黄檀属18种植物进行了叶片和中脉的比较解剖学研究，结果表明下皮层的存在与否、单宁的存在与否、乳突的分布式样可能在属下的组级或系级水平上具有分类价值;上表皮细胞的形状、栅栏组织的层数、维管系统的类型在种级水平上具有一定的分类学意义。
利用光镜观察了21种国产黄檀属植物叶表皮微形态，结果表明叶片毛被的分布式样在属下划分中具有一定的分类价值。多数种的上下表皮细胞的形状一致:或均为多边形，或均为无规则形，在组或系级水平上具有一定的分类学意义。少数种上下表皮细胞形状表现出不一致，在种级水平上有一定的分类价值。气孔器的分布式样（仅分布在下表皮）和类型（平列型）在该属内无分类学意义。
对全世界、中国产、中国和美洲产3个类群的植物进行MP建树，结果表明，黄檀属为单系类群，中国类群分为3支，并能初步与形态学相互对应。