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微生物一直是天然药物的宝贵资源，随着对现有普通环境微生物的不断研究，新化合物的发现几率越来越小。研究者开始将目光转移到特境微生物的发掘已开发上面。本课题从特境微生物资源(植物、昆虫内生菌)的分离开始，得到115株内生菌，其中真菌18株，放线菌97株，并从中发现4个潜在新物种，已发表2个。经活性-TLC及1H NMR-LC-MS筛选，选取3株目标菌株经扩大发酵后，利用硅胶、ODS反相柱、Sephadex LH-20和HPLC等色谱分离技术，分离得到31个单体化合物，采用波谱方法(HRESIMS、1HNMR、13C NMR、HSQC、COSY、HMBC、ROESY等)，鉴定了其中29个化合物，其中有14个为新化合物，1个为新的天然产物。 从喜树内生放线菌Streptomyces sp.YIM68216中得到7个化合物，包括黄酮类、嘧啶类，环二肽类等化合物，无新化合物。从喜树内生放线菌Streptomyces sp.YIM68119中得到8个化合物，6个为大环内酯类化合物(萘霉素类和巴佛洛霉素类化合物)，其中化合物10为新的天然产物，另有化合物15为新化合物，但经实验证实该化合物为人工产物，这些化合物都具有较好的抗菌、抗肿瘤活性。从蚂蚁内生真菌Spiromastix sp.MY-1中得到16个化合物，鉴定了14个化合物的结构，其中有13个为新化合物，化合物30、31也为新化合物，但具体结构需单晶数据确定。这些新化合物属于缩酚酸及缩酚酸环醚类化合物，其中大部分被卤素取代，并推测它们是经PKS合成途经生成前体，在氧化酶和卤代酶的作用下形成一系列的化合物。经活性检测，几乎全部化合物都具有显著的抗细菌活性，其中化合物20、21、24、26、28的某些活性与阳性对照相当，这也说明内生菌对其宿主有重要的生态学意义。 结果表明特境微生物或研究较少的微生物获得新化合物的几率要比普通环境微生物要大的多，而这些化合物是天然药物的重要来源。因此，特境微生物的发掘及其次生代谢产物值得我们继续深入研究。通过对目标菌株鉴定，发现微生物的代谢产物与物种类群在一定程度上存在着相关性，因此，在以后的代谢产物研究工作中，可以首先排除研究比较多的类群，以便减少工作量，提高出新率。