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2型糖尿病(T2DM)属于复杂遗传病,多种基因和环境因素共同参与糖尿病的致病过程,胰岛素抵抗导致外周组织对葡萄糖的利用减少和胰岛B细胞功能损害是其主要病理机制。通过对胰岛素信号传导负调节因子PTP1B(Protein-tyrosine Phosphatase-1B)编码基因PTPN1(Protein Tyrosine Phosphatase,non-receptor type 1)多态性的研究,探讨PTPN1与T2DM的相关性。人类PTPN1基因定位于20ql3.1-q13.2,编码的PTP1B参与胰岛素信号传导通路的调控:PTP1B通过对胰岛素受体激酶(insulin receptor kinase,IRK)或IRK活性片段和胰岛素受体底物-1(insulin receptor substrate-1,IRS1)的磷酸化酪氨酸残基去磷酸化作用对胰岛素信号传导进行负调节。PTPN1基因敲除小鼠不仅胰岛素敏感性增强,对饮食诱导的肥胖有很强的抵抗作用。因此PTPN1基因多态性可能参与T2DM的致病,因此将PTPN1基因作为T2DM的一个候选基因进行研究。本研究旨在了解西南地区汉族人群PTPN1基因SNPs及单体型频率分布,探讨SNP及其组成的单倍型与T2DM的关系,积累中国汉族人口PTPN1基因SNPs信息,有利于T2DM发病机理研究及预防治疗。研究目的研究中国西南地区汉族人PTPN1基因3个SNPs位点的等位基因频率、基因型频率及其组成单体型的分布特征。研究PTPN1基因SNPs及其单体型频率与T2DM的相关性。研究方法(1)通过美国国家生物信息中心(NCBI)的GenBank获取PTPN1基因序列及其相应位点的SNP信息。利用Primer Premier 5.0引物设计软件设计相应引物,并经NCBI的Blast2.0软件检验其特异性。(2)利用双向等位特异性PCR技术检测T2DM病人组及对照组PTPN1基因3个SNPs位点的基因型。(3)应用聚类分析方法分析基因多态性特征。研究结果(1)进一步证实了双向等位特异性PCR技术检测单核苷酸多态性的可行性,该法具有操作简便、费用低廉、结果稳定的优点。(2)PTPN1基因三个SNPs rs2904268、rs2230605、rs16995309优势等位基因(Allele 1)的频率在病人组及对照组分别为:0.611/0.686、0.648/0.642、0.708/0.691,两组等位基因频率分布无显著性差异(p值均大于0.05)。(3)SNPs rs2904268、rs2230605、rs16995309三位点等位基因型频率在病人组及对照组分别为:rs2904268 G/G型为0.361/0.480、G/C型为0.500/0.412、C/C型为0.139/0.108,两组等位基因型频率分布无显著性差异(p﹥0.05)。rs2230605 A/A型为0.380/0.382、A/G型为0.537/0.520、G/G型为0.083/0.098,两组等位基因型频率分布无显著性差异(p﹥0.05)。rs16995309 C/C型为0.481/0.549、C/T型为0.454/0.402、T/T型为0.065/0.049,两组等位基因型频率分布无显著性差异(p﹥0.05)。(4)三个SNPs位点可以组成八种单体型,在中国西南地区汉族人群中最常见的是C A C、G A C、G G C*,它们在病人组及对照组的频率分别为0.145/0.168、0.346/0.276、0.112/0.229,p值分别为0.522383、0.117102、0.001465,单体型G A T*、G G C*、G G T*在病人组及正常对照组的频率分别为0.069/0.155、0.112/0.229、0.083/0.027分布具有显著差异,p值分别为0.005001、0.001465、0.011742,统计有显著差异。提示单体型G A T*、G G C*、G G T*可能与中国西南地区汉族人群T2DM有关。结论(1)双向等位特异性PCR技术是一种较为简便、特异性较高、费用少、便于推广的SNP检测方法,尤其在已知SNP研究中较有优势。(2)本研究揭示了中国西南地区汉族人群PTPN1基因的3个SNPs基因单体型分布特征,为进一步研究其SNPs基因单体型与生理病例机制和疾病的关系提供理论参考。(3)PTPN1基因可能与中国西南地区汉族人群T2DM存在关联。