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玉米（Zea mays L.）是世界上重要的粮食兼饲料作物,产量居农作物之首,也是重要的遗传模式植物。我国是世界上仅次于美国的第二大玉米生产国,玉米生产在国民经济中占有非常重要的地位。因此,玉米的基础研究和遗传改良具有重大的理论和现实意义。近十余年来,玉米的基因组学和遗传转化一直是国内外研究的热点。 构建遗传连锁图谱是玉米基因组学研究的主要内容之一。目前已利用多种分子标记构建了高密度的玉米遗传连锁图谱。由于不同种质存在着基因组多样性及染色体结构变异等现象,利用其它作图群体构建的遗传图谱对特定种质进行基因定位、基因克隆等研究会产生较大偏差,甚至误入歧途。因此,以不同种质材料构建玉米遗传连锁图谱仍具有重要意义,是玉米基因组学研究的基础性工作。本工作利用自交系掖478×90110的F2群体构建玉米分子标记连锁图,为我国玉米优良基因源的深入开发和基因组学研究奠定基础。自交系掖478是我国选育的一个优良玉米自交系,具有高配合力、高产、抗倒及抗病性强等优点,为我国玉米生产作出了突出贡献,但该自交系对玉米病毒病的抗性较差。自交系90110具有抗玉米粗缩病、高产、高配合力等优良特性,是我国一个新的玉米类群—P类群的重要成员,该类群种质遗传基础丰富,是对原有杂种优势群的有效补充。 本工作检测了317个分子标记在双亲（掖478和90110）间的多态性,这些分子标记覆盖大部分玉米基因组。双亲间表现多态性的分子标记有215个,频率为67.8%。其中,双亲间多态性的RFLP标记有59个,占筛选RFLP标记的68.6%。利用五种限制酶酶切基因组DNA,发现在双亲间表现多态性的“RFLP探针/酶”组合有145个,占总组合数的33.7%。双亲间多态性的SSR标记有156个,占筛选的SSR标记的67.5%。根据Southern杂交或SSR电泳带谱,挑选149个双亲间多态性条带清晰的分子标记进行F2群体作图,群体样本由150个随机F2单株组成。经x2检验,13个分子标记在F2群体中表现偏分离,这些偏分离标记位子5条不同染色体上,其中在3、4和10号染色体上较多。其余分子标记的分离数据按要求建立文件(共