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我国经济发展的新常态需要产业结构的优化调整,以实现创新驱动和转型升级。高科技企业作为推进中国创新和转型升级的中坚力量,对于中国经济的发展尤显重要。而高科技企业的规范健康发展和壮大均离不开一个有效的风险管控机制,内部控制制度是现代企业风险管理机制的重要制度安排,是企业科学管理的基石,其保障着企业持续健康发展。对于高科技企业,建立有效的内部控制制度,识别并消除内部控制缺陷,使内部控制制度有效运行,有助于高科技企业健康、规范地成长。但是,鉴于高科技企业的特殊性,体现在高科技企业具有高风险、高无形资产比例、高人力资本价值等特性,因而其内部控制制度设计和运行中不充分考虑其个性特征,易使得其内部控制的建设以及运行中存在明显的内部控制缺陷。这些基于高科技企业特性的内部控制缺陷问题,亟待我们深入地认识、准确识别,和积极地消除,这既是理论问题又是实践问题,值得深入探究。本文以高科技类型企业为研究对象,在国内外内部控制理论以及风险管理理论的基础上,剖析了高科技企业的内部控制制度安排的特殊性,以及其内部控制缺陷的多样表现,本文进一步引入了N高科技企业的案例,深入地解剖了其存在的内部控制缺陷问题,以及探索了如何针对高科技企业的特征加强内部控制的建设和运行管控,并提出针对高科技企业的内部控制完善方案。本文的主要研究结论包括：(1)高科技企业的风险管理有其特殊性,体现在风险分布广,程度深,会给企业经营造成严重的负面影响,对内部控制有效管治风险需求很大,而且迫切；(2)高科技企业风险管控难度大,极易形成内部控制缺陷,会影响到高科技企业的财务报告的质量和经营管理效率,会拖累高科技企业的发展；(3)通过内部控制制度设计和运行环节的针对性改进,可帮助高科技企业有效识别和管控风险,以此改进和治理内部控制缺陷,维持高科技企业内部控制高效率地管控其风险。本文的研究有助于高科技企业完善内部控制制度、识别内部控制缺陷,也有助于投资者合理地评估高科技企业的投资风险,并为监管部门加强对高科技企业内部控制的监管提供有价值的参考。