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由于我国畜牧业的迅速发展,带动蛋白质的需求量逐年增高,我国主要靠进口鱼粉来解决蛋白质资源的不足,所以如何开发新的蛋白质资源是目前研究的热点。我国羽毛资源丰富,年产量达几十万吨,大量废弃羽毛造成巨大的资源浪费和环境污染。禽类羽毛的蛋白含量高,特别是胱氨酸含量为各种天然蛋白饲料之最。但禽类羽毛主要由角蛋白构成,肽链之间的二硫键使羽毛性质极其稳定。畜禽对未经处理的羽毛消化率较低。利用微生物发酵处理羽毛因具有能耗少,蛋白质和氨基酸含量高,环境污染小等优点而受到关注。本试验以特殊环境中的样品为研究对象,应用PCR-SSCP技术分析该样本中微生物种群,并筛选分离到三株羽毛角蛋白降解菌,NJQ1,NJQ2,NJQ3。经形态学观察、生理生化测定以及16SrRNA基因分析,初步认为这3种菌分别属于粪肠球菌(Enterococcus faecalis)、蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)。分别对NJQ1, NJQ2, NJQ3三种菌单菌液态发酵和混合液态发酵效果进行分析对比,并通过改变温度、pH值、接种量、接种比例、菌龄、无机盐、外加氮源碳源等培养条件,来提高羽毛发酵降解率,通过试验数据分析最佳的发酵条件为：初始pH8.5,接种量6%,菌种比例NJQ2：NJQ3为2：3,菌龄12h, K2HPO40.09g·L-1、KH2PO40.36g·L-1、NaCl0.3g·L-1、MgSO40.15g·L-1,37℃,180r·min-1培养48h。在最佳的培养条件下,对羽毛发酵进程进行研究,结果表发酵24h-36h时,锥形瓶内呈现棕深色浑浊的液体,羽毛结构明显破坏,发酵48h后,羽小枝几乎全部脱落降解,仅可见较为粗大的羽杆,降解率达到72%。本试验为羽毛角蛋白的降解提供了高效降解菌株,且菌种性质较为稳定,优化了液态混合发酵的发酵条件,使得发酵反应更快速有效的进行,且发酵产物安全可靠,为畜禽饲料蛋白质缺乏问题提供了一条经济安全的解决途径。