肠道病原菌39个可能共同缺失基因的分析和检测

来源 :中国疾病预防控制中心 | 被引量 : 0次 | 上传用户:godwin_z
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细菌在进化的过程中,不仅可通过水平转移的方式获得外源性的基因片段,获得毒力和致病性;还可以通过缺失部分基因,增强生命力和在特定环境下的生存能力,继而使毒力和致病性得以增强.以非致病性的大肠杆菌K12菌株MG1655的基因组序列为参照,将测序菌株志贺氏菌福氏2a 301菌株、沙门氏菌三个血清型(鼠伤寒LT2,伤寒CT18,甲型副伤寒)、肠出血性大肠杆菌O157:H7菌株EDL933的基因组序列与其进行比较,发现这些菌株共同缺失的基因有316个,其中有功能的基因136个.我们从中选取了39个基因,在志贺氏菌42个血清型、沙门氏菌8个血清型、肠致病性大肠杆菌、肠产毒性大肠杆菌、肠出血性大肠杆菌、肠黏附性大肠杆菌、肠侵袭性大肠杆菌、泌尿道致病性大肠杆菌,以及一些临床分离的疑似致泻性大肠杆菌中,利用PCR和打点杂交的方法对其进行了检测.检测结果表明,39个缺失基因在3类肠道病原菌中的缺失程度不等,致泻性大肠杆菌中的缺失率最低,平均为67.4﹪,其次为志贺氏菌,平均为86.0﹪,沙门氏菌的缺失率最高,平均为98.9﹪,这可能与肠道菌之间的亲源关系有关.
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