采用蛋白质组学方法筛选及鉴定肺癌血清中的标志分子

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为了筛选肺癌血清中具有诊断价值的标志分子。本研究首先采用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱蛋白质芯片技术(SELDI)检测了194例血清样品,其中包括154例肺癌和40例正常对照,采用WCX蛋白芯片选择性捕获血清蛋白,美国Ciphergen生物公司研制的蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的蛋白质谱采用Ciphergen公司的BiomarkWizard和BiomarkerPattern软件分析。  为了从肺癌病人血清中筛选到其他具有诊断或预后评判价值的标志分子,如自身抗体,对上述SELDI检测的部分血清样本进一步进行了免疫荧光和Westernblot检测。然后采用该病人的血清进行免疫沉淀,捕获的蛋白组分经质谱分析和数据库查询后确认,31kD条带为核内小核糖体蛋白U1-A。进一步对36例鳞癌、26例腺癌,31例小细胞肺癌和20例健康对照血清样本进行了免疫组化和Westernblot验证。  本文利用细胞分子生物学、蛋白质组学和生物信息学相结合的方法对肺癌血清进行了蛋白质谱和自身抗体检测,筛选出一组具有诊断价值的血清标志分子组合式样,发现并鉴定出一个与肺癌亚型和病程密切相关的自身抗体——U1-AsnRNP自身抗体。
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