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蒲氏黏盲鳗(学名:Eptatretus burgeri)是盲鳗科科盲鳗属属的一种，与七鳃鳗同属于圆口纲，是现存的最古老的脊椎动物。盲鳗作为最古老的脊椎动物，进化地位十分特殊，对于解释早期脊椎动物全基因组复制事件，早期脊椎动物的进化及体细胞重排事件（除生殖细胞外，体细胞会发生遗传信息的丢失）有重要的意义。针对盲鳗体细胞广泛存在的重排现象，我们选取了精巢DNA作为测序的来源，避开了体细胞的重排，并选取了另一个个体的脑，心，肝，肠，肾，肌肉，精巢，鳃和血共9个组织的DNA用于测序。找到了不同组织在体细胞重排过程中缺失的序列，对这部分序列进行了注释分析。最终发现，盲鳗体内存在的体细胞重排，发生缺失的序列主要是散在重复序列。对于发生重排的重要基因研究发现，这部分基因主要涉及癌症发生，早期发育及生殖有利的基因。这个结果暗示，体细胞重排过程清除了一部分对体细胞发育和功能无关的基因，即“体细胞无用基因”。进化分析方面，完成了系统发育树，正选择基因及快速进化基因分析，基因家族扩张收缩，结合已发表脊椎动物代表性物种基因组及转录组数据，脊索动物及棘皮动物基因组及转录组数据，找到脊椎动物大脑起源关键性基因及新基因。这部分基因功能主要集中在神经系统，突触功能及血压调节方面。暗示着脊椎动物早期进化过程中，神经系统的发育及血管心脏相关功能有一个巨大的变化，与无脊椎动物相比，脑及神经功能有一个质的变化。这一系列研究，有望理清脊椎动物早期进化模式及体细胞重排的格局，为后续的研究奠定了基础。 此外，该论文探讨了景东翅子树(学名:Pterospermum kingtungense)的生物学特性。景东翅子树属于梧桐科翅子树属，是云南省滇中地区石灰岩山地常绿阔叶林中的特有树种，是大径级用才树木，属于国家二级重点保护野生植物，濒危等级属极危。通过转录组数据的深入挖掘，并与已发表组学数据的最近缘的可可进行比较基因组学的分析，找到了景东翅子树快速生长及石灰岩土质适应性的相关基因。为景东翅子树这一云南特有种的研究提供了第一个组学数据，为后续的研究及濒危物种的保护提供了组学基因。