丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系的分子生物学比较

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丁香假单胞菌黄瓜致病变种(Pseudomonas syringae pv. lachrymans)引起的黄瓜细菌性角斑病在世界范围内皆有发生,造成不同程度的损失,同时也引起甜瓜细菌性叶斑病。以往研究表明黄瓜和甜瓜细菌性角斑病的病原均为丁香假单胞茵黄瓜致病变种,但在本实验室的研究中发现,丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系在致病性和分子生物学上存在一定差异。本研究对黄瓜细菌性角斑病菌黄瓜株系和甜瓜株系的致病性分别进行了测定与比较,并利用多个看家基因研究了二者的分子生物学差异,设计特异性引物将这两种寄主上的分离物加以区分。获得了以下主要研究成果:对丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系的16SrRNA和16S-23S rRNA进行了测序并建立了系统进化树,同时对这两个株系的分离物进行了致病性测定,结果显示,两种不同株系分离物的16S rRNA和16S-23S rRNA同源性均高达99%,同时两种分离物在甜瓜和黄瓜上存在致病性差异,在原寄主上发病更为严重;说明丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系属于同一个种,但在致病性上存在差异。对丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系的5个看家基因GAPDH基因、rpoD、rpoB、gyrB和gltA进行了序列测定并构建了系统发育树。系统发育分析表明,丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系分别聚在两个独立的分支簇里,说明两种分离物在遗传上存在明显差异。通过多重序列比较分析丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系以及丁香假单胞菌不同致病变种的GAPDH基因和ITS序列,分别设计了针对丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系的特异性引物(G-F/G-R)和甜瓜株系的特异性引物(ITS-F/ITS-R),两对引物均能把所有参试的这两个株系的菌株彼此区分。进一步证明了这2个株系可能为不同致病变种。综合上述结果,本研究建议将丁香假单胞菌黄瓜致病变种甜瓜株系命名为新的致病变种:丁香假单胞茵甜瓜致病变种Pseudomonas syringae pv. melonis pathovar nov.。
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