香蕉枯萎病菌突变体筛选及致病相关基因克隆

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香蕉枯萎病是由尖镰孢古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)侵染香蕉引起的维管束病害,近年来4号生理小种的迅速传播对世界香蕉生产构成了极大的威胁,从分子水平上揭示该病原菌的致病机理,将为开拓新的防治途径和选育抗病品种提供理论基础,也为尖镰孢的功能基因组学研究积累材料。   本研究在已经构建的香蕉枯萎病菌4号生理小种(FOC4)外源T-DNA插入突变体库中选取43个突变体菌株,通过致病力测定和表型研究,筛选得到致病力减弱或表型发生变异的9个突变体,编号分别为L1186、L39、L715、L953、X1071、X3617、X4138、X4394、X4420。Southern杂交结果表明,除了X4138为T-DNA双拷贝插入突变体外,其余8个均为T-DNA单拷贝插入。   采用TAIL-PCR和LA-PCR技术对8个单拷贝插入突变体进行基因克隆,获得5个突变体(L39、L715、L953、X1071、X4420)的T-DNA插入突变基因全长序列和3个突变体(L1186、X3617、X4394)的T-DNA侧翼序列,经生物信息学分析,同时结合致病力测定和表型试验,获得如下结果:   fo-CWDE编码蛋白与玉蜀黍赤霉Gibberella zeae Petch PH-1和红球丛赤壳Nectria haematococca mpVI 77-13-4假设蛋白具有高度同源性。通过突变体L715的致病力测定和表型分析,推断fo-CWDE与FOC4的两种胞外细胞壁降解酶CWDE(多聚半乳糖醛酸酶Peh和果胶酸裂解酶Pel)活性相关,进而影响菌株在香蕉中致病力。   fo-Acs/Faa编码的蛋白与G.zeae Petch PH-1的酰基辅酶A合成酶(Acs)具有81%的同源性,通过对突变体L953的表型分析和致病力测定,推断该基因在FOC4中的功能可能是保持细胞壁完整性并维持正常渗透压,若其发生突变将导致包括菌落性状、生长量、疏水性和产孢量在内的多方面表型发生变异,并使得病原菌丧失致病性和定殖能力。   fp-SP编码的蛋白含有跨膜转运蛋白超家族MFS保守结构域,并与黑白轮枝菌Verticillium albo-atrum的SP转运蛋白(MFS中最大的蛋白家族)具有54%的同源性,fo-SP对FOC4产孢量、香蕉假茎中的侵入和定殖能力、胞外纤维素酶Cel活性产生重要影响。   fo-L39的编码蛋白与G.zeae Petch PH-1假设蛋白具有87%的同源性,该假设蛋白功能未知。通过表型测定,推断基因fo-L39的功能是参与跨膜转运蛋白的合成或转运过程,该基因发生突变将影响FOC4的孢子形成,从而最终导致致病力的丧失。   fo-PAl/Rf编码的蛋白与G.zeae Petch PH-1的PAl和Rf蛋白结构具有79%的同源性,序列分析表明T-DNA的插入位点在该基因启动子上游位置,从而影响其表达,造成FOC4的产孢量、Cel活性降低,更具体的分析还有待进一步做RT-PCR和功能互补进行验证。   fo-MED14基因部分序列编码肽段与G.zeae Petch PH-1的MED14蛋白相应片段具有67-74%相似性,突变体Ll186的表型分析和致病力测定结果表明,该基因在FOC4中的功能可能是参与孢子的形成和Cel的合成,若其发生突变将导致致病力的丧失。   fo-GMA12/MNN10部分序列编码肽段与G.zeae Petch PH-1的半乳糖转移酶GMA12/MNN10假设蛋白相应片段具有91-92%的相似性,表型分析推断其发生突变将使得FOC4中的糖基转移酶合成受限,从而降低其对养分的利用能力和产孢能力,导致致病力丧失。   本研究还通过ATMT技术对突变体L715进行fo-CWDE基因的互补转化,互补转化子的胞外Peh和Pel酶活、致病力得到了恢复,进一步验证了该基因与FOC4的CWDE酶活相关,在致病过程中起着重要作用。
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